14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4048 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4048  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  295  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5803  hypothetical protein  59.23 
 
 
146 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573261  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4397  hypothetical protein  62.81 
 
 
144 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181293  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3869  hypothetical protein  58.46 
 
 
146 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.49105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4500  hypothetical protein  58.46 
 
 
146 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281814  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3933  hypothetical protein  66.04 
 
 
144 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.638367  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1350  hypothetical protein  64.81 
 
 
144 aa  146  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473408  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5315  hypothetical protein  65.09 
 
 
144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153696  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5279  hypothetical protein  65.62 
 
 
178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.40755  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1338  hypothetical protein  64.58 
 
 
171 aa  143  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839117  hitchhiker  0.00972358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1922  hypothetical protein  66.33 
 
 
141 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.017963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2543  hypothetical protein  44.92 
 
 
127 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3240  hypothetical protein  43.59 
 
 
129 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4107  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.38 
 
 
256 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>