14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2543 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2543  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  266  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3240  hypothetical protein  52.1 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4048  hypothetical protein  48.48 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5279  hypothetical protein  45.83 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1338  hypothetical protein  44.79 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839117  hitchhiker  0.00972358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5315  hypothetical protein  45.54 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5803  hypothetical protein  41.35 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3933  hypothetical protein  41.96 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.638367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1350  hypothetical protein  40.19 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473408  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4397  hypothetical protein  41.07 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181293  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3869  hypothetical protein  40.38 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.49105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4500  hypothetical protein  40.38 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1922  hypothetical protein  41.41 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.017963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4107  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>