14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3240 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3240  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  268  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2543  hypothetical protein  52.1 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4048  hypothetical protein  51.69 
 
 
144 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5279  hypothetical protein  54.02 
 
 
178 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.40755  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1338  hypothetical protein  51.11 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839117  hitchhiker  0.00972358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5803  hypothetical protein  47.83 
 
 
146 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573261  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1350  hypothetical protein  46.74 
 
 
144 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473408  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3869  hypothetical protein  46.74 
 
 
146 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.49105  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3933  hypothetical protein  45.65 
 
 
144 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.638367  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4500  hypothetical protein  46.74 
 
 
146 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281814  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5315  hypothetical protein  46.74 
 
 
144 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153696  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4397  hypothetical protein  45.65 
 
 
144 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181293  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1922  hypothetical protein  42.86 
 
 
141 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.017963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4107  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.91 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>