14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5279 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5279  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.40755  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1338  hypothetical protein  76.61 
 
 
171 aa  248  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839117  hitchhiker  0.00972358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1350  hypothetical protein  72.73 
 
 
144 aa  164  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473408  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5803  hypothetical protein  69.23 
 
 
146 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573261  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3869  hypothetical protein  68.27 
 
 
146 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.49105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4500  hypothetical protein  68.27 
 
 
146 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281814  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4397  hypothetical protein  66.36 
 
 
144 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181293  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5315  hypothetical protein  69 
 
 
144 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153696  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3933  hypothetical protein  68 
 
 
144 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.638367  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1922  hypothetical protein  71.11 
 
 
141 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.017963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4048  hypothetical protein  65.62 
 
 
144 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3240  hypothetical protein  52.17 
 
 
129 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2543  hypothetical protein  42.99 
 
 
127 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4107  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.79 
 
 
256 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>