More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1583 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1583  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 318 aa  633    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0650  methyl-accepting chemotaxis protein  37.41 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0684  methyl-accepting chemotaxis protein  37.07 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0739  methyl-accepting chemotaxis protein  37.83 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81832e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0595  methyl-accepting chemotaxis protein  37.83 
 
 		 314 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4621  methyl-accepting chemotaxis protein  37.42 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000649403 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0594  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 314 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0715  methyl-accepting chemotaxis protein  36.27 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0751  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0811  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1338  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 957 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.578016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1534  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1961  putative DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.7 
 
 		 417 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 		 807 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.891859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 443 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.31 
 
 		 442 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 		 812 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.01 
 
 		 654 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 941 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1774  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 		 671 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 		 638 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.7 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.27 
 
 		 638 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0250  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 		 518 aa  99.8  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.8 
 
 		 626 aa  99.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 647 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  30.8 
 
 		 689 aa  99.4  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 		 638 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 541 aa  99.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 739 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  38.32 
 
 		 540 aa  99  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  49.55 
 
 		 533 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 636 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  43.48 
 
 		 530 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5548  methyl-accepting chemotaxis protein  35.12 
 
 		 434 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.658857  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 		 558 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.96 
 
 		 1104 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.292314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.56 
 
 		 680 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 		 805 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5403  methyl-accepting chemotaxis protein  39.13 
 
 		 434 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00599432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.99 
 
 		 647 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 		 430 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  38.26 
 
 		 647 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 		 521 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00326538  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 		 638 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  33.01 
 
 		 564 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  50.83 
 
 		 521 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 596 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000672019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4122  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.48 
 
 		 676 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  44.53 
 
 		 647 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.34 
 
 		 525 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 		 549 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.81 
 
 		 431 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.613067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 543 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0038  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 		 581 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.36998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 		 674 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000256668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 		 601 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.416407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  38.27 
 
 		 538 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  37.79 
 
 		 645 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  46.09 
 
 		 657 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3595  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 515 aa  95.9  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.67 
 
 		 417 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.35 
 
 		 650 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0470  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  45.3 
 
 		 430 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.22 
 
 		 707 aa  95.9  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0356  methyl-accepting chemotaxis protein  45.3 
 
 		 430 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0339  methyl-accepting chemotaxis protein  45.3 
 
 		 430 aa  95.9  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0342  methyl-accepting chemotaxis protein  45.3 
 
 		 430 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 		 440 aa  95.9  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1963  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 		 539 aa  95.9  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.26 
 
 		 639 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  34.44 
 
 		 638 aa  95.9  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0370  methyl-accepting chemotaxis protein  45.3 
 
 		 430 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5552  methyl-accepting chemotaxis protein  40.3 
 
 		 433 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000569717  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.1 
 
 		 582 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  hitchhiker  0.00410847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  30.36 
 
 		 535 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0469  methyl-accepting chemotaxis protein  45.08 
 
 		 430 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2014  aerotaxis receptor  51.46 
 
 		 521 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 666 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  42.75 
 
 		 531 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2677  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.93 
 
 		 818 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.730239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 		 535 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.41 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 447 aa  95.5  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 675 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.41 
 
 		 432 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.58 
 
 		 540 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  32.46 
 
 		 638 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 528 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0086081  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 		 655 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44300  aerotaxis receptor Aer  50 
 
 		 521 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  34.32 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  36.67 
 
 		 533 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.85 
 
 		 531 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5276  methyl-accepting chemotaxis protein  38.41 
 
 		 433 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5519  methyl-accepting chemotaxis protein  38.41 
 
 		 433 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.04 
 
 		 528 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>