85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3015 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  100 
 
 
126 aa  242  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  68.49 
 
 
124 aa  103  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  53.26 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  44.68 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  45.16 
 
 
117 aa  83.6  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  44.9 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  48.98 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  30.95 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  44.33 
 
 
132 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  47.14 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  37.17 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  45.98 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  46.99 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  48.39 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  36.61 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  45.45 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  46.27 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  47.37 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  44.44 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  45.83 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  33.91 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  43.75 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  31.71 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  40.51 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  38.27 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  39.58 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  52.54 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5090  flagellar protein FlaG protein  36.59 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  31.2 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  38.81 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  36.19 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  30.47 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  34.07 
 
 
135 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  44.93 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  40 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1725  flagellar protein FlaG  36.99 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  30.77 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  35.8 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  33.73 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1499  flagellar protein FlaG protein  42.11 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  37.04 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0083  flagellar protein FlaG protein  37.62 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  33.73 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  34.72 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  27.78 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  33.8 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  34.72 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  32.5 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  38.81 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2219  flagellar protein FlaG protein  35.8 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  39.53 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0401  flagellar protein FlaG protein  27.42 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  34.67 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2230  flagellar protein FlaG protein  38.36 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000232456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1993  flagellar protein FlaG protein  28.57 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.434573  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1692  flagellar protein FlaG protein  36.25 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  42.59 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0093  flagellar protein FlaG  28 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1622  flagellar protein FlaG protein  36.25 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  32.91 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0765  flagellar protein FlaG  34.33 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.484129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0871  flagellar protein FlaG protein  27.78 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1654  flagellar protein FlaG protein  47.06 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0651  flagellar protein FlaG  25 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.470615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0233  hypothetical protein  33.72 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000522859  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0572  flagellar protein FlaG  25 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  34.72 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  34.38 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0311  flagellar protein FlaG protein  26.67 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0253  flagellar protein FlaG protein  30 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2431  flagellar protein FlaG protein  29.89 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17070  flagellar protein FlaG protein  30.88 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1527  flagellar protein FlaG protein  36 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0779  flagellar protein FlaG  30.49 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3569  flagellar protein FlaG protein  31.88 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2413  flagellar protein FlaG protein  26.51 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1451  flagellar protein FlaG protein  30 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1113  uncharacterized flagellar protein FlaG  35.71 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1034  flagellar protein FlaG  24.51 
 
 
131 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0854669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3016  flagellar protein FlaG  26.76 
 
 
120 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1383  flagellar protein FlaG  26.47 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3202  flagellar protein FlaG  27.78 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0463  flagellar protein FlaG protein  39.22 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.253336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0764  flagellar protein FlaG protein  27.71 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0984652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>