32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1451 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1451  flagellar protein FlaG protein  100 
 
 
136 aa  275  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  36.92 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  36.92 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  35.38 
 
 
129 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  30.49 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  33.85 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  33.85 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  33.87 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  35.38 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  33.85 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  35.29 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  38.33 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  30.49 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  34.48 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  31.58 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0623  flagellar protein FlaG protein  36.36 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  36.92 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  30 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  23.2 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3569  flagellar protein FlaG protein  39.22 
 
 
140 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  38.33 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  29.82 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  24.51 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  44.19 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  32.79 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0083  flagellar protein FlaG protein  26.61 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  24.29 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  25.81 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  30.3 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  29.7 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  32.31 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  34.62 
 
 
135 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.355745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>