81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3702 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  100 
 
 
117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  50.43 
 
 
118 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  45.16 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  41.86 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  43.08 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  44.44 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  56.79 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  55.56 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  56.58 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  43.09 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  48.98 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  37.61 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  43.02 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  43 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  49.15 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  36 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  42.06 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  40.66 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  42.86 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  36 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  50.85 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  44.78 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  41.03 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  48.61 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  46.05 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  38.3 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  43.28 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  42.65 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  42.65 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  46.27 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  36.19 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  34 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  42.5 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  41.18 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  42.47 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  39.44 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  39.71 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  41.38 
 
 
135 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  40.91 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1499  flagellar protein FlaG protein  37.97 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  45.31 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0401  flagellar protein FlaG protein  31.33 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1725  flagellar protein FlaG  38.96 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  42.42 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  44.44 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  39.73 
 
 
144 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1146  flagellar protein FlaG protein  28.74 
 
 
118 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3016  flagellar protein FlaG  26.32 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  48.08 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0083  flagellar protein FlaG protein  41.79 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0093  flagellar protein FlaG  26.8 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  29.17 
 
 
123 aa  50.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  29.41 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5090  flagellar protein FlaG protein  30.93 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1383  flagellar protein FlaG  34.29 
 
 
121 aa  50.1  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  26.42 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0253  flagellar protein FlaG protein  30.11 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0651  flagellar protein FlaG  34.29 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.470615  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0572  flagellar protein FlaG  34.29 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  39.13 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0765  flagellar protein FlaG  28.99 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.484129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  36.99 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1527  flagellar protein FlaG protein  35.62 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  42.31 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0993  flagellar protein FlaG protein  28.42 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1692  flagellar protein FlaG protein  30.38 
 
 
117 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1622  flagellar protein FlaG protein  31.17 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1993  flagellar protein FlaG protein  27.2 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.434573  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2431  flagellar protein FlaG protein  30.58 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  33.33 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  32.86 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2230  flagellar protein FlaG protein  30.88 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000232456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0764  flagellar protein FlaG protein  29.55 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0311  flagellar protein FlaG protein  27.4 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2219  flagellar protein FlaG protein  23.75 
 
 
131 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3202  flagellar protein FlaG  27.03 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0463  flagellar protein FlaG protein  35.06 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.253336  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1372  flagellar protein FlaG protein  28.75 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0292934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0871  flagellar protein FlaG protein  23.29 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1451  flagellar protein FlaG protein  32.79 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0779  flagellar protein FlaG  26.02 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>