69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1950 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  100 
 
 		 132 aa  258  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  86.15 
 
 		 130 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  60 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  48.55 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  48.41 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  43.08 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  65.67 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  49.35 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  39.37 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  39.84 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  44.33 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  43.84 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  32.14 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  42.47 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  32.14 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  35.09 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  46.48 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  37.33 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  42.11 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  36.36 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  37 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  32.74 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  34.15 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  38.36 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  44.62 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  32.05 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  36 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  31.25 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  30.43 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  39.44 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  41.38 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  33.02 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  40.32 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  40.91 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  35.62 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  34.18 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  33.8 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  33.75 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  34.18 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  39.62 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  34.85 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  28.57 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5090  flagellar protein FlaG protein  29.57 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1113  uncharacterized flagellar protein FlaG  39.71 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  35.85 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4190  flagellar protein FlaG protein  25.74 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  29.85 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  28.57 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1725  flagellar protein FlaG  28.57 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  35.59 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1499  flagellar protein FlaG protein  33.85 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0083  flagellar protein FlaG protein  34.44 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  32.39 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  26.4 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  34.43 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2219  flagellar protein FlaG protein  34.33 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1993  flagellar protein FlaG protein  34.15 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.434573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  30.91 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2230  flagellar protein FlaG protein  31.76 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000232456 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0253  flagellar protein FlaG protein  37.74 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2431  flagellar protein FlaG protein  32.84 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3569  flagellar protein FlaG protein  47.5 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1692  flagellar protein FlaG protein  26.55 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  26.87 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0765  flagellar protein FlaG  23.16 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.484129  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0093  flagellar protein FlaG  24.32 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  30.51 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  36.84 
 
 		 393 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0311  flagellar protein FlaG protein  22.73 
 
 		 124 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>