55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1113 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1113  uncharacterized flagellar protein FlaG  100 
 
 
124 aa  245  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  39.08 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  30.56 
 
 
128 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  34.69 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  30.56 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0764  flagellar protein FlaG protein  29.36 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  41.51 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  45.1 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  32.99 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  43.75 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  30 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  39.77 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  43.75 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  30.48 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  45.83 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  43.75 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  41.67 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  41.67 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  33.33 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  39.71 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  39.22 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  44.9 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  47.92 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  32.29 
 
 
130 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  38.24 
 
 
130 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  32.1 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  40 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0083  flagellar protein FlaG protein  42.31 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  30.77 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0253  flagellar protein FlaG protein  26.47 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  37.04 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  37.7 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2219  flagellar protein FlaG protein  34.55 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  25.64 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0993  flagellar protein FlaG protein  34.58 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  30.77 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3202  flagellar protein FlaG  33.33 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5090  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  46.67 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  35.29 
 
 
119 aa  42.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1993  flagellar protein FlaG protein  37.25 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.434573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1527  flagellar protein FlaG protein  26.89 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  39.22 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  40.43 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  35.71 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3569  flagellar protein FlaG protein  36.36 
 
 
140 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  32.77 
 
 
157 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  34.12 
 
 
129 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0311  flagellar protein FlaG protein  34.69 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  27.06 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  30.77 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0093  flagellar protein FlaG  30 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  41.67 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1654  flagellar protein FlaG protein  36.17 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0401  flagellar protein FlaG protein  38.3 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>