68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3465 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  100 
 
 
130 aa  253  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  86.15 
 
 
132 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  56.92 
 
 
119 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  50 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  41.86 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  44.44 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  43.94 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  44.9 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  49.3 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  36.64 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  33.59 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  47.89 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  44.44 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  41.1 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  37.3 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  34.62 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  46.15 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  33.33 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  36.36 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  35 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  37.97 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  36.36 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  34.13 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  42.11 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  31.58 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  34.15 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  38.46 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  32.05 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  33.91 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  32.05 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  39.74 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  46.3 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  34.69 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  43.4 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  28 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  28.44 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  28.57 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  36.51 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  31.91 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  32 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  33.04 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  36.07 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  31.63 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0083  flagellar protein FlaG protein  39.62 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5090  flagellar protein FlaG protein  28.85 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  36.54 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  30.53 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1499  flagellar protein FlaG protein  33.85 
 
 
113 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1113  uncharacterized flagellar protein FlaG  38.24 
 
 
124 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3569  flagellar protein FlaG protein  30.77 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  34.33 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1725  flagellar protein FlaG  27.63 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  32.81 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  33.85 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1993  flagellar protein FlaG protein  30.61 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.434573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4190  flagellar protein FlaG protein  26.32 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  33.9 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  28.36 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0311  flagellar protein FlaG protein  25.45 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2219  flagellar protein FlaG protein  32.84 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0233  hypothetical protein  30.93 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000522859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  30.51 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0401  flagellar protein FlaG protein  32.79 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1637  flagellin FlaG, putative  33.33 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.145506  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2230  flagellar protein FlaG protein  30 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000232456 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1527  flagellar protein FlaG protein  34.25 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1692  flagellar protein FlaG protein  25.93 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>