63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1449 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  100 
 
 
143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  43.06 
 
 
129 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  40.45 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  42.86 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  43.66 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  44.93 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  34.78 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  33.33 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  43.08 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  36.08 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  42.42 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  45.31 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  34.23 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  40.3 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  43.75 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  39.24 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  42.42 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1725  flagellar protein FlaG  31.33 
 
 
153 aa  52.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  40.62 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  34.38 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  32.56 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2413  flagellar protein FlaG protein  26.17 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  37.31 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  35 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  39.13 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  32.47 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  30.3 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  33.33 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  44.68 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1499  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  29.29 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  40 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  31.31 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  37.1 
 
 
128 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  38.89 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  35.94 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  36.76 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0401  flagellar protein FlaG protein  27.27 
 
 
123 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  33.33 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  46.81 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  35.59 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  35.9 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  38.6 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  34.92 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  34.38 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  34.38 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2219  flagellar protein FlaG protein  27 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2230  flagellar protein FlaG protein  35.59 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000232456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3016  flagellar protein FlaG  31.82 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  33.9 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1654  flagellar protein FlaG protein  32.86 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0764  flagellar protein FlaG protein  31.91 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1113  uncharacterized flagellar protein FlaG  30.77 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1451  flagellar protein FlaG protein  23.2 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791716  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0253  flagellar protein FlaG protein  28.21 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  31.31 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0311  flagellar protein FlaG protein  30 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1692  flagellar protein FlaG protein  29.63 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0765  flagellar protein FlaG  27.14 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.484129  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1622  flagellar protein FlaG protein  28.4 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  31.25 
 
 
128 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>