59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2219 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2219  flagellar protein FlaG protein  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  64.86 
 
 
128 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1654  flagellar protein FlaG protein  42.19 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  37.69 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0311  flagellar protein FlaG protein  48.61 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0463  flagellar protein FlaG protein  50.75 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.253336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2413  flagellar protein FlaG protein  52.31 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17070  flagellar protein FlaG protein  35.71 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2230  flagellar protein FlaG protein  46.15 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000232456 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0253  flagellar protein FlaG protein  42.47 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3202  flagellar protein FlaG  37.17 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  36.25 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3016  flagellar protein FlaG  35.48 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  41.94 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0764  flagellar protein FlaG protein  27.91 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4190  flagellar protein FlaG protein  26.19 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0871  flagellar protein FlaG protein  36.11 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  35.29 
 
 
143 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  35.8 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  35.29 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  24.35 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  32.97 
 
 
123 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  35.38 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0233  hypothetical protein  33.64 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000522859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  33.82 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  25.37 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  27.72 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  27.56 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  33.33 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1692  flagellar protein FlaG protein  40 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1622  flagellar protein FlaG protein  38.67 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0993  flagellar protein FlaG protein  32.84 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  28.36 
 
 
135 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  31.67 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  37.29 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  26.15 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1499  flagellar protein FlaG protein  38.46 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02915  FlaG  28.46 
 
 
171 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0190193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  34.85 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0623  flagellar protein FlaG protein  34.43 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  27 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  34.33 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  31.67 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1372  flagellar protein FlaG protein  31.82 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0292934  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1113  uncharacterized flagellar protein FlaG  34.55 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0401  flagellar protein FlaG protein  33.85 
 
 
123 aa  42.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  34.85 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  31.88 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  32.84 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  23.75 
 
 
117 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1527  flagellar protein FlaG protein  34.78 
 
 
124 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  27.27 
 
 
114 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  26.47 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  29.85 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  29.13 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5090  flagellar protein FlaG protein  29.23 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  27.55 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  25.64 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2431  flagellar protein FlaG protein  32.65 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>