70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0505 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  100 
 
 
137 aa  276  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  43.12 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  39.67 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1725  flagellar protein FlaG  32.31 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  46.48 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  40.22 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  45.83 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  37.72 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  35.24 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  43.24 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  44.78 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  43.24 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  40.54 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  41.89 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  36.61 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  44.44 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  42.47 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  46.88 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  38.64 
 
 
119 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  40.54 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  42.86 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  37 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  40.54 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  40.85 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  47.22 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  39.74 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  45.45 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  44.83 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  39.39 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  38.89 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  40.28 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  41.18 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  36 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  38.81 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  36.05 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  28.57 
 
 
157 aa  53.9  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  36.36 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  35.14 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  39.19 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  36.62 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0083  flagellar protein FlaG protein  31.16 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  31.78 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2230  flagellar protein FlaG protein  35.29 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000232456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  47.27 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  40.58 
 
 
130 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  29.46 
 
 
123 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  33.33 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  38.1 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0253  flagellar protein FlaG protein  38.57 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  42.25 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2219  flagellar protein FlaG protein  33.82 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1499  flagellar protein FlaG protein  31.94 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  35.48 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1654  flagellar protein FlaG protein  32.39 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  32.5 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3569  flagellar protein FlaG protein  36.11 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17070  flagellar protein FlaG protein  29.85 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1622  flagellar protein FlaG protein  31.33 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1146  flagellar protein FlaG protein  28.99 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2413  flagellar protein FlaG protein  28.57 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4190  flagellar protein FlaG protein  31.88 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3016  flagellar protein FlaG  31.34 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1383  flagellar protein FlaG  28.77 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1692  flagellar protein FlaG protein  28.92 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  28.79 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  28.36 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0651  flagellar protein FlaG  28.77 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.470615  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0572  flagellar protein FlaG  28.77 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0311  flagellar protein FlaG protein  25.64 
 
 
124 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>