59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03170 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  81.25 
 
 
144 aa  234  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1725  flagellar protein FlaG  52.94 
 
 
153 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  33.33 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  45.83 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  38.4 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  40.52 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  40.52 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  37.66 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  42.11 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  39.45 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  35.16 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  48.44 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  40 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  45.59 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  49.21 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  40.74 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  35 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  46.05 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  32.82 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  45.45 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  34.13 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  34.23 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  33.86 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  38.82 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  37.14 
 
 
117 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  40.35 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  32.5 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  36.62 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  35.71 
 
 
132 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  31.58 
 
 
119 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  30.97 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  38.81 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  35.53 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  35 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  32.99 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  34.72 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  31.63 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  41.51 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  33.66 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  36.99 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  36 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3569  flagellar protein FlaG protein  40.74 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  31.11 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  28.06 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1450  hypothetical protein  26.83 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000269237  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  30.83 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1654  flagellar protein FlaG protein  26.89 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  30.91 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0993  flagellar protein FlaG protein  30.26 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  30.77 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2230  flagellar protein FlaG protein  31.25 
 
 
129 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000232456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  41.1 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2413  flagellar protein FlaG protein  27.78 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1451  flagellar protein FlaG protein  29.82 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3016  flagellar protein FlaG  31.25 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1993  flagellar protein FlaG protein  33.7 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.434573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4190  flagellar protein FlaG protein  24.69 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>