50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1993 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1993  flagellar protein FlaG protein  100 
 
 
124 aa  247  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.434573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  50.5 
 
 
123 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  43.75 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  35.71 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5090  flagellar protein FlaG protein  41.07 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  38.24 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  35.23 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  38.57 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  42.42 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  42.59 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1527  flagellar protein FlaG protein  30.25 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  33.72 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  28.57 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  31.4 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  33.8 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  36.23 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  42.17 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  31.34 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  38.89 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  35.21 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  35.94 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  35.29 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  31.33 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17070  flagellar protein FlaG protein  27.06 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  37.5 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  32.08 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  32.14 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  40.38 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  27.2 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  35.71 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  28.95 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  35.71 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  30.61 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  37.31 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  34.15 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  32.56 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  33.82 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  33.82 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1113  uncharacterized flagellar protein FlaG  37.25 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  37.25 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  34.92 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  34.12 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  34.62 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  40.38 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  43.14 
 
 
137 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  33.7 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  30.38 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>