79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3236 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  100 
 
 		 119 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  94.12 
 
 		 128 aa  222  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  79.49 
 
 		 128 aa  186  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  78.63 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  80.67 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  76.07 
 
 		 128 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  76.07 
 
 		 128 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  52.17 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  55.17 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  49.57 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  55.1 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  58.26 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  65.71 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  56.41 
 
 		 157 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  53.26 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  45 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  36.59 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  36.28 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  40.26 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  40.22 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  32.14 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  39.45 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  46.97 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  36.78 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  34.62 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  33.05 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  42.65 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  39.68 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  36.19 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  42.86 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  35.51 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  40.54 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  36.19 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  38.24 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1725  flagellar protein FlaG  37.84 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0093  flagellar protein FlaG  28.95 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  36.51 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  45.31 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3569  flagellar protein FlaG protein  34.48 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  40.98 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  32.43 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  33.8 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  40.32 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  36.54 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  48.15 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0401  flagellar protein FlaG protein  37.29 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1113  uncharacterized flagellar protein FlaG  30.56 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  37.33 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1499  flagellar protein FlaG protein  30.99 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0765  flagellar protein FlaG  27.43 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.484129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2230  flagellar protein FlaG protein  33.78 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000232456 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0572  flagellar protein FlaG  30.34 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1383  flagellar protein FlaG  32.39 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0651  flagellar protein FlaG  30.34 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.470615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  32.81 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  30 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0764  flagellar protein FlaG protein  32.35 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1451  flagellar protein FlaG protein  36.92 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791716  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5090  flagellar protein FlaG protein  33.33 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  38.46 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0083  flagellar protein FlaG protein  43.4 
 
 		 126 aa  48.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1993  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.434573  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  26.56 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  39.62 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1146  flagellar protein FlaG protein  28.79 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2413  flagellar protein FlaG protein  26.37 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1527  flagellar protein FlaG protein  33.82 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00123965  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1034  flagellar protein FlaG  32.94 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0854669  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0779  flagellar protein FlaG  30.12 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  34 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  34.38 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0993  flagellar protein FlaG protein  25.58 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02915  FlaG  26.19 
 
 		 171 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0190193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1692  flagellar protein FlaG protein  27.27 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0253  flagellar protein FlaG protein  26.87 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  33.33 
 
 		 123 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1622  flagellar protein FlaG protein  32.81 
 
 		 122 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0871  flagellar protein FlaG protein  22.89 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  30.67 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>