159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1245 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1245  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  100 
 
 
364 aa  751    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1761  fructose-bisphosphate aldolase  74.65 
 
 
361 aa  564  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165684  normal  0.0733362 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1611  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  36.44 
 
 
379 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.455667  normal  0.226673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1969  fructose-bisphosphate aldolase  36.09 
 
 
379 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0218  ketose-bisphosphate aldolase class-II  31.38 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3299  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  28.78 
 
 
427 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000284986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3253  ketose-bisphosphate aldolase class-II  29.93 
 
 
427 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1007  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  29.93 
 
 
427 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000202403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3305  ketose-bisphosphate aldolase family protein  29.59 
 
 
426 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0149261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1193  ketose-bisphosphate aldolase family protein  28.78 
 
 
428 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0742776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2284  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  29.24 
 
 
429 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2383  fructose-bisphosphate aldolase  28.16 
 
 
427 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563565  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2461  ketose-bisphosphate aldolase family protein  27.44 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30.27 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.46 
 
 
308 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0467  fructose/tagatose bisphosphate aldolase  24.38 
 
 
305 aa  63.5  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0246198  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  27.45 
 
 
307 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.22 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.48 
 
 
288 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  27.13 
 
 
292 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  26.29 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  26.29 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  26.29 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  26.29 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.04 
 
 
284 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  26.29 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  26.29 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  26.29 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  26.13 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  28.68 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.48 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  28.85 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.07 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  27.97 
 
 
283 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0396  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.76 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  30.94 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1705  ketose-bisphosphate aldolase  27.99 
 
 
274 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.37 
 
 
323 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  30.69 
 
 
286 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0324  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
283 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.743524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.92 
 
 
311 aa  56.2  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  24.75 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0238  fructose-bisphosphate aldolase  26.24 
 
 
288 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3994  fructose-bisphosphate aldolase, class II  27.53 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0332  Tagatose-bisphosphate aldolase  27.92 
 
 
283 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  27.11 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  29.3 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  29.3 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  23.7 
 
 
330 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  29.53 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16610  fructose-bisphosphate aldolase  29.41 
 
 
278 aa  52.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  23.97 
 
 
324 aa  52.8  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  25.78 
 
 
283 aa  52.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  27.8 
 
 
281 aa  52.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0127  fructose-bisphosphate aldolase  24.68 
 
 
293 aa  52.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000349017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  25.09 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0025  aldolase  23.22 
 
 
472 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2145  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  32.24 
 
 
451 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000526082  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2822  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.12 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000185169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 
295 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  28 
 
 
287 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.09 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  27.1 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  27 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  24.43 
 
 
281 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2168  fructose-bisphosphate aldolase  23.75 
 
 
298 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00424601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.2 
 
 
313 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25 
 
 
313 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  26.25 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1008  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  32.12 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.833631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.05 
 
 
286 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.82 
 
 
307 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  23.91 
 
 
281 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  22.57 
 
 
312 aa  50.1  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5927  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  36.14 
 
 
450 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0657  ketose-bisphosphate aldolase class-II  23.27 
 
 
292 aa  49.7  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  29.21 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1033  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  32.28 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.27 
 
 
297 aa  49.3  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.5 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  25.2 
 
 
324 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0630  tagatose 6 phosphate kinase  32.28 
 
 
481 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2464  putative tagatose 6-phosphate kinase gatZ  32.28 
 
 
481 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0870  tagatose 6-phosphate kinase  32.28 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0874  tagatose 6-phosphate kinase  32.28 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02021  putative tagatose 6-phosphate kinase 1  33.04 
 
 
420 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.23 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  23.98 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01987  hypothetical protein  33.04 
 
 
420 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.09 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3106  tagatose-6-phosphate kinase  27.74 
 
 
429 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00963647  hitchhiker  0.000335639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0288  tagatose-6-phosphate kinase  35.29 
 
 
428 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0701  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  23.85 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1143  putative tagatose-6-phosphate kinase  33.04 
 
 
420 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.291767  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2153  fructose-bisphosphate aldolase, class II  30.13 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3074  putative tagatose-6-phosphate kinase  33.04 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.47 
 
 
284 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0969  putative tagatose-6-phosphate kinase  33.04 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  25.91 
 
 
286 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  23.51 
 
 
324 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>