106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1611 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1611  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  100 
 
 
379 aa  781    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.455667  normal  0.226673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1969  fructose-bisphosphate aldolase  56.08 
 
 
379 aa  448  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1761  fructose-bisphosphate aldolase  37.04 
 
 
361 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165684  normal  0.0733362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1245  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  36.44 
 
 
364 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0218  ketose-bisphosphate aldolase class-II  35.89 
 
 
421 aa  143  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3299  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  32.96 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000284986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3253  ketose-bisphosphate aldolase class-II  36.73 
 
 
427 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1007  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  36.73 
 
 
427 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000202403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3305  ketose-bisphosphate aldolase family protein  31.99 
 
 
426 aa  92.8  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0149261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2383  fructose-bisphosphate aldolase  32.84 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563565  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2461  ketose-bisphosphate aldolase family protein  33.68 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1193  ketose-bisphosphate aldolase family protein  32.72 
 
 
428 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0742776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2284  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  31.37 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0025  aldolase  26.71 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.68 
 
 
308 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.74 
 
 
354 aa  59.7  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.83 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  30.21 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.61 
 
 
308 aa  56.2  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.23 
 
 
307 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  24.4 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.39 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.48 
 
 
284 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  27.79 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0361  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.67 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000396687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1705  ketose-bisphosphate aldolase  23.49 
 
 
274 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3955  fructose-bisphosphate aldolase  29.13 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.145603  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3304  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  29.13 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2844  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  23.31 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0299  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0267498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0997  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0665  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0691  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.858155  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0594  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2428  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0836  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0841  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0040  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.72 
 
 
313 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.72 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1039  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.99 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2029  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  25.62 
 
 
359 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.394674  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.74 
 
 
305 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2015  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.72 
 
 
354 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2626  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.72 
 
 
354 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0937863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2655  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.72 
 
 
354 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2673  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.53 
 
 
354 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000776519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.7 
 
 
313 aa  49.7  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2546  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.53 
 
 
354 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0573  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.4 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2492  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.52 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4630  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.12 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0935  fructose-bisphosphate aldolase, class II  28.44 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.31 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.99 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.27 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.119495  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.82 
 
 
311 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  32.02 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2255  ketose-bisphosphate aldolase  26.15 
 
 
280 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000023078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  23.88 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  23.32 
 
 
345 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000980725  decreased coverage  0.000076105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3869  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.88 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652473  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0291  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.19 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0178057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1489  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.48 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156888  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2804  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.63 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07230  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.61 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4576  fructose-bisphosphate aldolase  26.74 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.47 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0304491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.58 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08011  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.27 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0594842  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0658  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.61 
 
 
354 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0317  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  29.9 
 
 
432 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0839239  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0994  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.72 
 
 
359 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  0.788402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.91 
 
 
354 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0967  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.72 
 
 
359 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5696  ketose-bisphosphate aldolase  27.85 
 
 
313 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4602  fructose-bisphosphate aldolase  25.18 
 
 
357 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1613  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.07 
 
 
344 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3218  fructose-bisphosphate aldolase  25.07 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4747  fructose-bisphosphate aldolase, class II  23.98 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  23.91 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.62 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.02 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.03 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  23.91 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0506  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.61 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  26.77 
 
 
285 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2849  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  24.53 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0980884  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3248  fructose-bisphosphate aldolase, class II  24.53 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4960  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.61 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4833  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.61 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05600  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.15 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5262  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.1 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0503  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.74 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3106  tagatose-6-phosphate kinase  29.7 
 
 
429 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00963647  hitchhiker  0.000335639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5009  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.15 
 
 
354 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2033  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.38 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000857052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>