More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0361 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0573  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  89.24 
 
 		 354 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  88.39 
 
 		 354 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4576  fructose-bisphosphate aldolase  86.4 
 
 		 354 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  88.1 
 
 		 354 aa  647    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0361  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 354 aa  727    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000396687 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3304  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  85.27 
 
 		 354 aa  630  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3955  fructose-bisphosphate aldolase  84.99 
 
 		 354 aa  628  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.145603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0935  fructose-bisphosphate aldolase, class II  84.14 
 
 		 370 aa  621  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  82.44 
 
 		 354 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0503  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  81.59 
 
 		 354 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3869  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  83 
 
 		 354 aa  604  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4747  fructose-bisphosphate aldolase, class II  80.17 
 
 		 354 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5097  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.38 
 
 		 354 aa  584  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0204  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.6 
 
 		 354 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0291  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.89 
 
 		 354 aa  578  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4630  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  78.19 
 
 		 354 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1489  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.05 
 
 		 354 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0040  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.07 
 
 		 354 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0841  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.07 
 
 		 354 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0836  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.07 
 
 		 354 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2546  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.5 
 
 		 354 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0299  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.07 
 
 		 354 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0267498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0997  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.07 
 
 		 354 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0665  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.07 
 
 		 354 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2655  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.5 
 
 		 354 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2015  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.5 
 
 		 354 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0594  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.07 
 
 		 354 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2673  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.5 
 
 		 354 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000776519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2428  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.07 
 
 		 354 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2626  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.5 
 
 		 354 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0937863  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.22 
 
 		 354 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.37 
 
 		 354 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0691  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.65 
 
 		 354 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.858155  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.94 
 
 		 354 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0461  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.24 
 
 		 354 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.671902  normal  0.237356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3037  fructose-bisphosphate aldolase, class II  70.82 
 
 		 354 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0370  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.1 
 
 		 354 aa  537  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1530  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.39 
 
 		 354 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.67 
 
 		 354 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1815  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.67 
 
 		 354 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.267172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05600  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.97 
 
 		 354 aa  528  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.92 
 
 		 354 aa  529  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0390  fructose-bisphosphate aldolase, class II  70.25 
 
 		 354 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.25 
 
 		 354 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07230  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.41 
 
 		 354 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.69 
 
 		 354 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1912  fructose-bisphosphate aldolase, class II  71.67 
 
 		 354 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0658  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.12 
 
 		 354 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4960  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.69 
 
 		 354 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.82 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000879946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5009  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.69 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4833  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.69 
 
 		 354 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2844  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.41 
 
 		 354 aa  519  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0506  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.69 
 
 		 354 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3218  fructose-bisphosphate aldolase  69.41 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3876  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.34 
 
 		 354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2849  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  71.1 
 
 		 356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0980884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5262  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.41 
 
 		 354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3248  fructose-bisphosphate aldolase, class II  71.1 
 
 		 356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2386  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  68.56 
 
 		 354 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.64 
 
 		 345 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2492  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.77 
 
 		 359 aa  512  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  69.28 
 
 		 345 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.99 
 
 		 354 aa  508  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4602  fructose-bisphosphate aldolase  67.61 
 
 		 357 aa  504  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0163  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.64 
 
 		 355 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0408428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1443  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.71 
 
 		 357 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.57 
 
 		 345 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000980725  decreased coverage  0.000076105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4099  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.71 
 
 		 359 aa  507  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109682  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2804  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.86 
 
 		 354 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1039  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.01 
 
 		 354 aa  501  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0875  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.14 
 
 		 355 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0830  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.71 
 
 		 355 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.254898  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3537  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.71 
 
 		 355 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0933  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.14 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0708  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.31 
 
 		 345 aa  499  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0417855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0877  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.71 
 
 		 354 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000290228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.71 
 
 		 355 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.31 
 
 		 345 aa  499  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.262233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3656  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.71 
 
 		 355 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0776  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.14 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0266968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3247  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.14 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2029  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  66.38 
 
 		 359 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.394674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.14 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000198413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2756  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.42 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1086  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.42 
 
 		 355 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000814215  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0879  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.99 
 
 		 354 aa  497  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0791  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.14 
 
 		 354 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.475428  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0650  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.38 
 
 		 354 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196207  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3041  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.19 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3047  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.19 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.57 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.119495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4316  fructose-bisphosphate aldolase, class II  65.71 
 
 		 355 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0229  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.59 
 
 		 363 aa  488  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0994  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.86 
 
 		 359 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  0.788402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0967  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.86 
 
 		 359 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1974  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.59 
 
 		 363 aa  488  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.43 
 
 		 359 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0304491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1988  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.66 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0362683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.76 
 
 		 349 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0152373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>