136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2383 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1193  ketose-bisphosphate aldolase family protein  87.79 
 
 
428 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0742776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2383  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
427 aa  877    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563565  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3253  ketose-bisphosphate aldolase class-II  77.75 
 
 
427 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3305  ketose-bisphosphate aldolase family protein  81.37 
 
 
426 aa  732    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0149261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3299  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  80.56 
 
 
427 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000284986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1007  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  77.52 
 
 
427 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000202403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2284  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  72.17 
 
 
429 aa  622  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2461  ketose-bisphosphate aldolase family protein  70.39 
 
 
419 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0218  ketose-bisphosphate aldolase class-II  42.15 
 
 
421 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1969  fructose-bisphosphate aldolase  32.36 
 
 
379 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1245  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  28.16 
 
 
364 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1761  fructose-bisphosphate aldolase  30.22 
 
 
361 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165684  normal  0.0733362 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1611  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  32.84 
 
 
379 aa  90.5  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.455667  normal  0.226673 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.44 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  30.13 
 
 
293 aa  63.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2532  fructose-bisphosphate aldolase  26.67 
 
 
281 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08395e-19 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0127  fructose-bisphosphate aldolase  29.57 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000349017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2337  fructose-bisphosphate aldolase  26.67 
 
 
281 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2300  fructose-bisphosphate aldolase  26.67 
 
 
281 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2516  fructose-bisphosphate aldolase  26.67 
 
 
281 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0081  fructose-bisphosphate aldolase  25.88 
 
 
281 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2168  fructose-bisphosphate aldolase  28.42 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00424601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  27 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  26.44 
 
 
283 aa  62  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.1 
 
 
288 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.669513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.1 
 
 
288 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.626031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  27 
 
 
284 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  27 
 
 
284 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0305  fructose-bisphosphate aldolase  25.88 
 
 
281 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  30.13 
 
 
286 aa  59.3  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  29.61 
 
 
286 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  29.61 
 
 
286 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1712  fructose-bisphosphate aldolase  27.56 
 
 
279 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  25.49 
 
 
281 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  24.21 
 
 
281 aa  58.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  27.04 
 
 
283 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.99 
 
 
297 aa  57.4  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  24.8 
 
 
325 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
285 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
285 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  29.53 
 
 
286 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
285 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
285 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
285 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
285 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
285 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
285 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
285 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
285 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  23.72 
 
 
281 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl644  fructose-biphosphate aldolase  28.41 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  24.26 
 
 
309 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  30.57 
 
 
288 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.49 
 
 
309 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  23.72 
 
 
281 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  31.93 
 
 
285 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  27.87 
 
 
308 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  27 
 
 
284 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  27 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  27 
 
 
284 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  27 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.92 
 
 
308 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.32 
 
 
284 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  27 
 
 
284 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  27 
 
 
284 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.28 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.81 
 
 
284 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  26.84 
 
 
292 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  25 
 
 
278 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  29.02 
 
 
286 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  29.02 
 
 
286 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.28 
 
 
313 aa  53.9  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  29.02 
 
 
286 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  29.02 
 
 
286 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2255  ketose-bisphosphate aldolase  29.13 
 
 
280 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000023078 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  29.02 
 
 
286 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  26.58 
 
 
284 aa  53.5  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  29.02 
 
 
286 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  29.02 
 
 
286 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  27.59 
 
 
287 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0467  fructose/tagatose bisphosphate aldolase  28.37 
 
 
305 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0246198  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  26.58 
 
 
284 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0396  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.91 
 
 
290 aa  53.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  29.55 
 
 
284 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.14 
 
 
307 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.25 
 
 
287 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.11 
 
 
288 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  25.76 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  27.09 
 
 
293 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  27.11 
 
 
284 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  31.45 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.47 
 
 
284 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.69 
 
 
284 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  23.25 
 
 
330 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  23.25 
 
 
330 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  23.25 
 
 
330 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  27.84 
 
 
316 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  27.06 
 
 
285 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  23.38 
 
 
330 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.53 
 
 
283 aa  49.7  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>