133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1193 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1193  ketose-bisphosphate aldolase family protein  100 
 
 
428 aa  876    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0742776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2383  fructose-bisphosphate aldolase  87.79 
 
 
427 aa  771    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563565  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3253  ketose-bisphosphate aldolase class-II  75.41 
 
 
427 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3305  ketose-bisphosphate aldolase family protein  82.55 
 
 
426 aa  731    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0149261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3299  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  79.91 
 
 
427 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000284986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2284  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  74.53 
 
 
429 aa  642    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1007  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  75.18 
 
 
427 aa  651    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000202403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2461  ketose-bisphosphate aldolase family protein  72.38 
 
 
419 aa  623  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0218  ketose-bisphosphate aldolase class-II  42.78 
 
 
421 aa  249  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1969  fructose-bisphosphate aldolase  32.96 
 
 
379 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1245  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  28.78 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1761  fructose-bisphosphate aldolase  30.22 
 
 
361 aa  89.7  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165684  normal  0.0733362 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1611  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  32.72 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.455667  normal  0.226673 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  30.59 
 
 
287 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2532  fructose-bisphosphate aldolase  27.06 
 
 
281 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08395e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2337  fructose-bisphosphate aldolase  27.06 
 
 
281 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2516  fructose-bisphosphate aldolase  27.06 
 
 
281 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2300  fructose-bisphosphate aldolase  27.06 
 
 
281 aa  63.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2168  fructose-bisphosphate aldolase  28.67 
 
 
298 aa  63.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00424601  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  26.75 
 
 
283 aa  61.2  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  28.9 
 
 
293 aa  60.8  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0305  fructose-bisphosphate aldolase  26.27 
 
 
281 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  28.68 
 
 
286 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  24.7 
 
 
309 aa  60.1  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  25.88 
 
 
281 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  27.78 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  25.91 
 
 
325 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0081  fructose-bisphosphate aldolase  25.11 
 
 
281 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  30.6 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  30.6 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  27.55 
 
 
283 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  34.58 
 
 
286 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0127  fructose-bisphosphate aldolase  28.52 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000349017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  28.29 
 
 
286 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  28.29 
 
 
286 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  28.29 
 
 
286 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  28.29 
 
 
286 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  28.29 
 
 
286 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  28.29 
 
 
286 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  28.29 
 
 
286 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  29.52 
 
 
285 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.49 
 
 
288 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.669513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.49 
 
 
288 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.626031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1712  fructose-bisphosphate aldolase  27.11 
 
 
279 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  30 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.03 
 
 
309 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  29.52 
 
 
285 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.43 
 
 
297 aa  54.7  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.66 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  30 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  30 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.14 
 
 
307 aa  55.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  29.2 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  29.2 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  29.2 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  29.2 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  31.93 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2255  ketose-bisphosphate aldolase  29.87 
 
 
280 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000023078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  29.2 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  29.2 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  29.2 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  23.89 
 
 
281 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl644  fructose-biphosphate aldolase  29.05 
 
 
296 aa  53.9  0.000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  23.89 
 
 
281 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  23.84 
 
 
284 aa  53.5  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.81 
 
 
284 aa  53.5  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  24.9 
 
 
281 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  26.86 
 
 
308 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  28.76 
 
 
285 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  28.19 
 
 
287 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.12 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2358  ketose-bisphosphate aldolase  28.65 
 
 
278 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0595665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1492  fructose-bisphosphate aldolase  26.64 
 
 
286 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00472623  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  25.32 
 
 
278 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.12 
 
 
313 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
287 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  30.67 
 
 
288 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  25.39 
 
 
292 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.15 
 
 
284 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  27.38 
 
 
283 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0701  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.94 
 
 
289 aa  51.2  0.00003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.12 
 
 
308 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  25.53 
 
 
283 aa  51.2  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4019  ketose-bisphosphate aldolase  27.71 
 
 
283 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.53 
 
 
307 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  22.91 
 
 
324 aa  50.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0467  fructose/tagatose bisphosphate aldolase  28.71 
 
 
305 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0246198  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  23.79 
 
 
324 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.32 
 
 
307 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.63 
 
 
323 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  24.91 
 
 
330 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  24.91 
 
 
330 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  24.91 
 
 
330 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  24.91 
 
 
330 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0396  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.96 
 
 
290 aa  49.7  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  29.55 
 
 
284 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  29.55 
 
 
284 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  29.55 
 
 
284 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  26.58 
 
 
284 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  29.55 
 
 
284 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>