More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1492 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1492  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00472623  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0455  fructose-bisphosphate aldolase  59.64 
 
 		 412 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0616426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1676  fructose-bisphosphate aldolase class II family protein  57.65 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1374  ketose-bisphosphate aldolase class-II  57.3 
 
 		 393 aa  278  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.332544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4026  hypothetical protein  40.85 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0129  hypothetical protein  40.85 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  40.85 
 
 		 286 aa  215  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5597  hypothetical protein  39.79 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  39.35 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.37 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1033  hypothetical protein  38.65 
 
 		 286 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  37.65 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  35.59 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.65 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  39.08 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0305  fructose-bisphosphate aldolase  36.17 
 
 		 281 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  38.73 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 		 285 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  37.85 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  38.73 
 
 		 285 aa  178  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  37.75 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  38.38 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.49 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.33 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2337  fructose-bisphosphate aldolase  39.24 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2516  fructose-bisphosphate aldolase  39.24 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0081  fructose-bisphosphate aldolase  36.44 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2300  fructose-bisphosphate aldolase  39.24 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  37.68 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  37.68 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0504  ketose-bisphosphate aldolase  35.77 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  38.78 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  38.78 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  38.78 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2532  fructose-bisphosphate aldolase  38.82 
 
 		 281 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08395e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  38.78 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  38.78 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4019  ketose-bisphosphate aldolase  35.92 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  38.37 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  35.54 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  37.72 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  38.37 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  38.03 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  38.78 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  38.37 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  35.17 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0332  Tagatose-bisphosphate aldolase  39.68 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  40.35 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  43.16 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  37.86 
 
 		 281 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  37.86 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  41.88 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3438  ketose-bisphosphate aldolase  39.34 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0588169  hitchhiker  0.000131538 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.09 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  35.36 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  34.77 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  42.86 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.95 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  34.06 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  38.46 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  36.99 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  36.99 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  36.99 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.7 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.7 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0323  hypothetical protein  41.99 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1650  Tagatose-bisphosphate aldolase  35.04 
 
 		 289 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  36.73 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0331  hypothetical protein  41.99 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.220687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  39.27 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  36.59 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  36.59 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  36.59 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  36.59 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  36.59 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  36.59 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  36.59 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  36.59 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  38.08 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.81 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.36 
 
 		 305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.64 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  39.63 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0324  Tagatose-bisphosphate aldolase  40.08 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.743524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.58 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.3 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  38.49 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2255  ketose-bisphosphate aldolase  38.82 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000023078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1230  ketose-bisphosphate aldolase  37.96 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000139711  normal  0.0508866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3994  fructose-bisphosphate aldolase, class II  38.89 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.17 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3218  ketose-bisphosphate aldolase  37.55 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  35.92 
 
 		 292 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>