172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1761 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1761  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
361 aa  743    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165684  normal  0.0733362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1245  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  74.65 
 
 
364 aa  564  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1611  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  37.04 
 
 
379 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.455667  normal  0.226673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1969  fructose-bisphosphate aldolase  34.82 
 
 
379 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0218  ketose-bisphosphate aldolase class-II  34.03 
 
 
421 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2383  fructose-bisphosphate aldolase  30.22 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563565  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3305  ketose-bisphosphate aldolase family protein  27.52 
 
 
426 aa  90.5  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0149261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1193  ketose-bisphosphate aldolase family protein  30.22 
 
 
428 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0742776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3299  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  29.14 
 
 
427 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000284986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2284  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  31.05 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3253  ketose-bisphosphate aldolase class-II  28.57 
 
 
427 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1007  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  28.57 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000202403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2461  ketose-bisphosphate aldolase family protein  29.45 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.5 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.57 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0324  Tagatose-bisphosphate aldolase  31.17 
 
 
283 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.743524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.95 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0467  fructose/tagatose bisphosphate aldolase  25.08 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0246198  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.04 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  26.62 
 
 
285 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.52 
 
 
308 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  29.32 
 
 
283 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  26.81 
 
 
307 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  26.51 
 
 
283 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0332  Tagatose-bisphosphate aldolase  29.14 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3994  fructose-bisphosphate aldolase, class II  28.33 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  31.33 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0504  ketose-bisphosphate aldolase  25.22 
 
 
277 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0396  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.07 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.84 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  28.27 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  26.67 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  25.77 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  26.15 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.64 
 
 
308 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  30.46 
 
 
286 aa  57  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0081  fructose-bisphosphate aldolase  23.97 
 
 
281 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 
308 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  25.75 
 
 
281 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30 
 
 
286 aa  56.2  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  30.51 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  25.93 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  30.39 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0305  fructose-bisphosphate aldolase  26.12 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  23.86 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2337  fructose-bisphosphate aldolase  25.37 
 
 
281 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2516  fructose-bisphosphate aldolase  25.37 
 
 
281 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2386  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  33.33 
 
 
430 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  30.32 
 
 
284 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2300  fructose-bisphosphate aldolase  25.28 
 
 
281 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.35 
 
 
307 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.74 
 
 
312 aa  53.5  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.56 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  25.29 
 
 
281 aa  53.5  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16610  fructose-bisphosphate aldolase  28.92 
 
 
278 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.56 
 
 
313 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.57 
 
 
288 aa  53.5  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  27.47 
 
 
281 aa  53.1  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  29.28 
 
 
281 aa  53.1  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.38 
 
 
284 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3106  tagatose-6-phosphate kinase  29.69 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00963647  hitchhiker  0.000335639 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  29.8 
 
 
287 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.04 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  29.59 
 
 
287 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.19 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1705  ketose-bisphosphate aldolase  27.61 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2532  fructose-bisphosphate aldolase  24.91 
 
 
281 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08395e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1008  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  32.5 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.833631  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0025  aldolase  25.47 
 
 
472 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.72 
 
 
307 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  26.92 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  29.63 
 
 
278 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0238  fructose-bisphosphate aldolase  25.68 
 
 
288 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  25.49 
 
 
295 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3572  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  30.3 
 
 
431 aa  50.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.219278 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.18 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  24.77 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  24.77 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  24.77 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  24.77 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  24.77 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  24.77 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  24.77 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3772  putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.42 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  27.48 
 
 
285 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4111  putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.62 
 
 
286 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.142897  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  24.77 
 
 
286 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  27.57 
 
 
287 aa  49.7  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
284 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1163  Tagatose-bisphosphate aldolase  30.13 
 
 
274 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.97 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  26.22 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  26.22 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  26.22 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  23.59 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.63 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  26.22 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4828  putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.42 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>