More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2962 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  98.6 
 
 
285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  61.87 
 
 
284 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  63.7 
 
 
283 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  59.5 
 
 
284 aa  358  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  59.5 
 
 
284 aa  358  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  59.5 
 
 
284 aa  356  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  60.14 
 
 
284 aa  348  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  59.79 
 
 
330 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  59.79 
 
 
330 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  59.79 
 
 
330 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  59.79 
 
 
330 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  57.65 
 
 
284 aa  345  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  57.3 
 
 
292 aa  332  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  57.65 
 
 
292 aa  332  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  57.09 
 
 
286 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  57.09 
 
 
286 aa  331  8e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  57.09 
 
 
286 aa  331  8e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  57.09 
 
 
286 aa  331  8e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  57.09 
 
 
286 aa  331  8e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  57.09 
 
 
286 aa  331  8e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  57.09 
 
 
286 aa  331  8e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  57.09 
 
 
286 aa  331  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  57.61 
 
 
281 aa  329  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  57.61 
 
 
281 aa  328  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  55.32 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  55.32 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  55.32 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  55.32 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  55.32 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  55.32 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  55.32 
 
 
284 aa  326  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  54.96 
 
 
284 aa  324  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  54.61 
 
 
284 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  53.57 
 
 
283 aa  304  9.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  53.07 
 
 
284 aa  299  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  49.28 
 
 
284 aa  281  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  49.1 
 
 
283 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.86 
 
 
284 aa  275  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.43 
 
 
284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  47.23 
 
 
284 aa  268  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  48.16 
 
 
309 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.1 
 
 
284 aa  261  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  48.85 
 
 
287 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  43.61 
 
 
309 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  45.28 
 
 
323 aa  259  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.88 
 
 
307 aa  259  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.96 
 
 
284 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.75 
 
 
286 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  47.86 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  48.21 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.77 
 
 
288 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  44.55 
 
 
307 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.37 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  41.86 
 
 
316 aa  248  8e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.03 
 
 
307 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  42.52 
 
 
307 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.69 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.79 
 
 
308 aa  241  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.81 
 
 
307 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.17 
 
 
313 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.17 
 
 
313 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  41.84 
 
 
295 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1045  fructose-bisphosphate aldolase  41.08 
 
 
324 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468946  unclonable  0.00000168547 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.77 
 
 
308 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.58 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2822  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.48 
 
 
320 aa  232  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000185169  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  42.14 
 
 
281 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2033  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.67 
 
 
325 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000857052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.56 
 
 
328 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  41.35 
 
 
324 aa  230  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.94 
 
 
311 aa  229  5e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.55 
 
 
312 aa  228  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  44.52 
 
 
285 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  39.74 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  40.38 
 
 
324 aa  225  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  44.37 
 
 
287 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1325  fructose-bisphosphate aldolase  40.13 
 
 
374 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  39.14 
 
 
327 aa  222  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1362  fructose-bisphosphate aldolase  39.74 
 
 
324 aa  222  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  43.66 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  43.46 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  43.66 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  43.66 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  43.66 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  43.46 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  43.66 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  43.66 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  43.66 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  43.66 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2625  ketose-bisphosphate aldolase  42.09 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  39.94 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  43.31 
 
 
285 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  39.1 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  42.76 
 
 
287 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  43.31 
 
 
285 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  42.25 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  39.86 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.67 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0353  fructose-bisphosphate aldolase  39.46 
 
 
325 aa  210  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.198569  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>