More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1253 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
324 aa  660    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  92.28 
 
 
324 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1362  fructose-bisphosphate aldolase  90.12 
 
 
324 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  90.74 
 
 
324 aa  609  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  87.96 
 
 
324 aa  597  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1045  fructose-bisphosphate aldolase  84.88 
 
 
324 aa  577  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468946  unclonable  0.00000168547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1325  fructose-bisphosphate aldolase  86.42 
 
 
374 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2822  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  79.25 
 
 
320 aa  536  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000185169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  72.92 
 
 
325 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0353  fructose-bisphosphate aldolase  71.83 
 
 
325 aa  485  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.198569  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  73.73 
 
 
327 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2033  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  65.2 
 
 
325 aa  450  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000857052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  66.04 
 
 
328 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  62.34 
 
 
311 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  61.78 
 
 
309 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  54.81 
 
 
307 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  55.95 
 
 
307 aa  349  4e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  55.63 
 
 
307 aa  348  7e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  56.69 
 
 
309 aa  340  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  55.31 
 
 
307 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  55.41 
 
 
308 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  54.26 
 
 
323 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  53.7 
 
 
307 aa  329  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1613  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.06 
 
 
344 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5097  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.17 
 
 
354 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3869  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.37 
 
 
354 aa  272  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652473  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0573  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.15 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4747  fructose-bisphosphate aldolase, class II  46.08 
 
 
354 aa  269  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.05 
 
 
354 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.05 
 
 
354 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.19 
 
 
345 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000980725  decreased coverage  0.000076105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0935  fructose-bisphosphate aldolase, class II  47.8 
 
 
370 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0291  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.35 
 
 
354 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0178057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0204  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.25 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4576  fructose-bisphosphate aldolase  46.06 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  45.07 
 
 
345 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2029  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  46.11 
 
 
359 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.394674  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0765  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.39 
 
 
363 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.290883  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4630  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.48 
 
 
354 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.35 
 
 
354 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000879946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.83 
 
 
349 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.37 
 
 
354 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3304  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  46.37 
 
 
354 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2546  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.05 
 
 
354 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2673  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.05 
 
 
354 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000776519  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1530  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.78 
 
 
354 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3955  fructose-bisphosphate aldolase  45.02 
 
 
354 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.145603  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  42.69 
 
 
338 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1489  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.23 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156888  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2015  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.05 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2655  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.05 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6004  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.11 
 
 
362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086132  decreased coverage  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2626  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.05 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0937863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0040  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
354 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0836  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
354 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0841  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
354 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0461  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
354 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.671902  normal  0.237356 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0299  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
354 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0267498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0997  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
354 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0594  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
354 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0665  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
354 aa  258  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2428  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
354 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
354 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.74 
 
 
354 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.85 
 
 
354 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.58 
 
 
354 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.01 
 
 
345 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.75 
 
 
355 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.550526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2369  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.75 
 
 
355 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2492  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.45 
 
 
359 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1815  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.88 
 
 
354 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.267172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0503  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.86 
 
 
354 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6928  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.49 
 
 
355 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  0.18115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2325  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.26 
 
 
355 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320028  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08011  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.23 
 
 
357 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0594842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3876  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.63 
 
 
354 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.11 
 
 
354 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0691  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.84 
 
 
354 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.858155  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0877  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.79 
 
 
354 aa  255  9e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000290228  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.95 
 
 
356 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0390  fructose-bisphosphate aldolase, class II  43.11 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0875  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.119495  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7283  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.26 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0373571  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0776  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0266968  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3247  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2995  ketose-bisphosphate aldolase  45.08 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.273933  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000198413  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0361  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.51 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000396687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0879  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.38 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1086  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.58 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000814215  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1857  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.32 
 
 
357 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.62 
 
 
305 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0650  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.11 
 
 
354 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196207  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0871  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.44 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0933  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.69 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4602  fructose-bisphosphate aldolase  44.55 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2904  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.75 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0830  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.06 
 
 
355 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.254898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3656  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.06 
 
 
355 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>