More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2253 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
327 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  79.88 
 
 
325 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0353  fructose-bisphosphate aldolase  70.94 
 
 
325 aa  489  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.198569  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1325  fructose-bisphosphate aldolase  74.29 
 
 
374 aa  487  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  74.05 
 
 
324 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  73.73 
 
 
324 aa  484  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  72.73 
 
 
324 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2822  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  71.25 
 
 
320 aa  478  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000185169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  73.1 
 
 
324 aa  473  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1045  fructose-bisphosphate aldolase  70.22 
 
 
324 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468946  unclonable  0.00000168547 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1362  fructose-bisphosphate aldolase  71.84 
 
 
324 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2033  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  61.39 
 
 
325 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000857052  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  60.69 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  61.54 
 
 
309 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  58.33 
 
 
311 aa  358  8e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  55.38 
 
 
309 aa  349  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  53.5 
 
 
307 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  53.65 
 
 
307 aa  346  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  54.89 
 
 
323 aa  344  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  52.38 
 
 
307 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  52.38 
 
 
307 aa  335  5e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  50.79 
 
 
307 aa  326  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  52.85 
 
 
308 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  46.89 
 
 
330 aa  272  7e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.59 
 
 
354 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0390  fructose-bisphosphate aldolase, class II  47.59 
 
 
354 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2995  ketose-bisphosphate aldolase  46.08 
 
 
316 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.273933  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1613  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.03 
 
 
344 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.57 
 
 
345 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000980725  decreased coverage  0.000076105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3876  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.08 
 
 
354 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.86 
 
 
354 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0791  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.31 
 
 
354 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.475428  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  46.35 
 
 
312 aa  259  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0875  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.9 
 
 
355 aa  259  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0776  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.96 
 
 
355 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0266968  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3247  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.96 
 
 
355 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.96 
 
 
355 aa  259  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000198413  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0933  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.96 
 
 
355 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3869  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.67 
 
 
354 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652473  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2492  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.62 
 
 
359 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4960  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.15 
 
 
354 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5262  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.17 
 
 
354 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0658  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.08 
 
 
354 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0506  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.17 
 
 
354 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5009  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.17 
 
 
354 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07230  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.48 
 
 
354 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4833  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.15 
 
 
354 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0879  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.08 
 
 
354 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.41 
 
 
354 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.119495  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3037  fructose-bisphosphate aldolase, class II  45.17 
 
 
354 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0650  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.38 
 
 
354 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05600  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.86 
 
 
354 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.72 
 
 
355 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3537  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.72 
 
 
355 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0830  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.72 
 
 
355 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.254898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3656  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.72 
 
 
355 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0877  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.77 
 
 
354 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000290228  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  45.97 
 
 
311 aa  255  6e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1086  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.72 
 
 
355 aa  255  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000814215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2756  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.08 
 
 
355 aa  255  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5097  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.09 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0163  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.86 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0408428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4747  fructose-bisphosphate aldolase, class II  45.22 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2029  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  44.05 
 
 
359 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.394674  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1443  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.13 
 
 
357 aa  253  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  43.52 
 
 
338 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4630  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.73 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  45.66 
 
 
345 aa  252  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  44.08 
 
 
316 aa  252  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2713  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.77 
 
 
359 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2386  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  42.68 
 
 
354 aa  251  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1988  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.78 
 
 
338 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0362683  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.86 
 
 
354 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.55 
 
 
354 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4602  fructose-bisphosphate aldolase  45.34 
 
 
357 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0204  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.72 
 
 
354 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.59 
 
 
354 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1974  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.77 
 
 
363 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0229  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.77 
 
 
363 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.27 
 
 
354 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0573  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.59 
 
 
354 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3248  fructose-bisphosphate aldolase, class II  45.05 
 
 
356 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2849  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  45.05 
 
 
356 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0980884  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0708  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.38 
 
 
345 aa  249  6e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0417855  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.38 
 
 
345 aa  249  6e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.262233  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.69 
 
 
354 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0370  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.79 
 
 
354 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0291  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.37 
 
 
354 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0178057 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2904  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.88 
 
 
354 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2447  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.13 
 
 
345 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.63 
 
 
313 aa  247  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0871  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.8 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.41 
 
 
347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105194  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5696  ketose-bisphosphate aldolase  46.02 
 
 
313 aa  245  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3218  fructose-bisphosphate aldolase  45.48 
 
 
354 aa  246  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0994  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.77 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  0.788402 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.31 
 
 
313 aa  245  8e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0967  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.77 
 
 
359 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0818  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.8 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.44 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0304491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>