More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0324 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0324  Tagatose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
283 aa  577  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.743524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0332  Tagatose-bisphosphate aldolase  92.93 
 
 
283 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3994  fructose-bisphosphate aldolase, class II  59.72 
 
 
283 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  46.43 
 
 
293 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  37.37 
 
 
284 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  35.84 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2337  fructose-bisphosphate aldolase  35.84 
 
 
281 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2516  fructose-bisphosphate aldolase  35.84 
 
 
281 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2532  fructose-bisphosphate aldolase  35.84 
 
 
281 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08395e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2300  fructose-bisphosphate aldolase  35.84 
 
 
281 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.96 
 
 
286 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.82 
 
 
283 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.58 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0305  fructose-bisphosphate aldolase  35.61 
 
 
281 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  38.55 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.14 
 
 
284 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0081  fructose-bisphosphate aldolase  33.69 
 
 
281 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  36.07 
 
 
286 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0504  ketose-bisphosphate aldolase  36.03 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.33 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1492  fructose-bisphosphate aldolase  41.13 
 
 
286 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00472623  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4026  hypothetical protein  35.87 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0129  hypothetical protein  35.87 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4019  ketose-bisphosphate aldolase  34.04 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.59 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  37.37 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  37.37 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  37.5 
 
 
284 aa  162  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
284 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
284 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
284 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5597  hypothetical protein  35.38 
 
 
286 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.19 
 
 
284 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  34.03 
 
 
283 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  34.32 
 
 
316 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  36.68 
 
 
284 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  37.15 
 
 
284 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  37.15 
 
 
284 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.71 
 
 
284 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  37.2 
 
 
295 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  36.13 
 
 
281 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  33.45 
 
 
281 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  38.3 
 
 
287 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  30.67 
 
 
330 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  37.55 
 
 
285 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  34.72 
 
 
287 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  33.1 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  37.6 
 
 
307 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.77 
 
 
308 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  31.1 
 
 
281 aa  152  7e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  33.1 
 
 
283 aa  151  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  31.11 
 
 
312 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  36.79 
 
 
284 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  39.57 
 
 
285 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  35.88 
 
 
287 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  39.15 
 
 
285 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  35.06 
 
 
278 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  39.15 
 
 
285 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  39.15 
 
 
285 aa  148  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  39.15 
 
 
285 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  39.15 
 
 
285 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  39.15 
 
 
285 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  39.15 
 
 
285 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2625  ketose-bisphosphate aldolase  39.34 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.15 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  38.72 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1033  hypothetical protein  35.51 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.76 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2058  fructose-bisphosphate aldolase, class II  33.33 
 
 
278 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  hitchhiker  0.00173454 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.76 
 
 
313 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  33.81 
 
 
284 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  37.15 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.33 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0455  fructose-bisphosphate aldolase  37.66 
 
 
412 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0616426 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  34.26 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  32.99 
 
 
286 aa  145  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  33.45 
 
 
286 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  33.45 
 
 
286 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3218  ketose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
280 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0657  ketose-bisphosphate aldolase class-II  35.12 
 
 
292 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  34.81 
 
 
284 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  34.81 
 
 
284 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01742  predicted aldolase  32.53 
 
 
278 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.665846  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  35.27 
 
 
330 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  35.27 
 
 
284 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  35.27 
 
 
330 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  31.8 
 
 
311 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  35.27 
 
 
330 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01730  hypothetical protein  32.53 
 
 
278 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.843477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2497  fructose-bisphosphate aldolase, class II family  32.53 
 
 
278 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  35.27 
 
 
330 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  31.61 
 
 
323 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1869  ketose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
278 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00279551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1857  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
278 aa  142  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00760876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1997  fructose-bisphosphate aldolase, class II  32.53 
 
 
278 aa  142  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1859  ketose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
278 aa  142  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.175434  decreased coverage  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1418  fructose-bisphosphate aldolase  32.53 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.75 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  32.23 
 
 
285 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  34.44 
 
 
284 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>