More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3994 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3994  fructose-bisphosphate aldolase, class II  100 
 
 
283 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0332  Tagatose-bisphosphate aldolase  57.6 
 
 
283 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0324  Tagatose-bisphosphate aldolase  59.72 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.743524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  45.07 
 
 
293 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.2 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  37.7 
 
 
284 aa  168  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  37.97 
 
 
284 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.91 
 
 
286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  35.21 
 
 
281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0504  ketose-bisphosphate aldolase  37.31 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2337  fructose-bisphosphate aldolase  35.21 
 
 
281 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  36.71 
 
 
281 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2516  fructose-bisphosphate aldolase  35.21 
 
 
281 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2300  fructose-bisphosphate aldolase  35.21 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0305  fructose-bisphosphate aldolase  37.45 
 
 
281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.06 
 
 
284 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2532  fructose-bisphosphate aldolase  34.86 
 
 
281 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08395e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  35.34 
 
 
284 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  32.69 
 
 
313 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  35.41 
 
 
308 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.72 
 
 
330 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  32.69 
 
 
313 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.63 
 
 
284 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.4 
 
 
284 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1492  fructose-bisphosphate aldolase  38.89 
 
 
286 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00472623  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  37.72 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  41.98 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  38.63 
 
 
287 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  34.86 
 
 
295 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4019  ketose-bisphosphate aldolase  36.86 
 
 
283 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.65 
 
 
287 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  36.36 
 
 
278 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
286 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  34.42 
 
 
283 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  32.29 
 
 
287 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  38.11 
 
 
284 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  35 
 
 
284 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  35 
 
 
284 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.97 
 
 
308 aa  149  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  37.5 
 
 
286 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  37.5 
 
 
286 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
286 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  37.5 
 
 
286 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
286 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
286 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
286 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  34.64 
 
 
284 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  37.01 
 
 
283 aa  149  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4026  hypothetical protein  35.66 
 
 
286 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0129  hypothetical protein  35.66 
 
 
286 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  41.51 
 
 
307 aa  148  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5597  hypothetical protein  34.42 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  34.64 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  34.64 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  34.64 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
287 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2058  fructose-bisphosphate aldolase, class II  34.2 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  hitchhiker  0.00173454 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  38.36 
 
 
285 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  32.34 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.33 
 
 
312 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  34.29 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  34.29 
 
 
284 aa  145  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
285 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
285 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
285 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.33 
 
 
311 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
285 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
285 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
285 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
285 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1869  ketose-bisphosphate aldolase  33.77 
 
 
278 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00279551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1418  fructose-bisphosphate aldolase  33.77 
 
 
278 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1705  ketose-bisphosphate aldolase  34.87 
 
 
274 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1859  ketose-bisphosphate aldolase  33.77 
 
 
278 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.175434  decreased coverage  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  37.07 
 
 
292 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0455  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
412 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0616426 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.84 
 
 
288 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1997  fructose-bisphosphate aldolase, class II  33.77 
 
 
278 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  37.23 
 
 
284 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1857  fructose-bisphosphate aldolase  33.77 
 
 
278 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00760876  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  37.23 
 
 
284 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  37.23 
 
 
284 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.86 
 
 
287 aa  143  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  37.93 
 
 
285 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  33.57 
 
 
284 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1456  ketose-bisphosphate aldolase  40.91 
 
 
293 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3218  ketose-bisphosphate aldolase  33.77 
 
 
280 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01742  predicted aldolase  33.33 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.665846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01730  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.843477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2497  fructose-bisphosphate aldolase, class II family  33.33 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1033  hypothetical protein  33.57 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2625  ketose-bisphosphate aldolase  37.39 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3438  ketose-bisphosphate aldolase  36.48 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0588169  hitchhiker  0.000131538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  33.76 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0323  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  36.8 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>