More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0323 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0323  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0331  hypothetical protein  98.25 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.220687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  80.07 
 
 		 286 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  69.69 
 
 		 287 aa  428  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  53.15 
 
 		 285 aa  299  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.14 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.37 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.76 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5597  hypothetical protein  43.36 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.37 
 
 		 287 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.85 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  41.34 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  43.01 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0129  hypothetical protein  42.05 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4026  hypothetical protein  42.05 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.42 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1033  hypothetical protein  42.46 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.44 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.61 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  39.79 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.41 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  39.79 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  38.87 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  39.44 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  38.54 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  38.67 
 
 		 316 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  39.86 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.07 
 
 		 305 aa  191  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  37.72 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  36.11 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  35.42 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  39.08 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  35.42 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  37.68 
 
 		 281 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  35.5 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  37.68 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  37.37 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  37.67 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  36.81 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.41 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  37.11 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  37.11 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  37.11 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  37.11 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  37.11 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  37.11 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  37.11 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  37.11 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  35.06 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.76 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  36.84 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  36.84 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  36.84 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  35.37 
 
 		 345 aa  178  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  34.25 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.28 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  36.71 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.36 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.64 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.25 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105194  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  34.93 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2625  ketose-bisphosphate aldolase  36.64 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  35.82 
 
 		 285 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3041  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.67 
 
 		 354 aa  175  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3047  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.67 
 
 		 354 aa  175  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589963  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.44 
 
 		 354 aa  175  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0765  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.7 
 
 		 363 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.290883  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  34.04 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.15 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000980725  decreased coverage  0.000076105 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  35.82 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  34.04 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  34.04 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  34.04 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  34.04 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  34.04 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  34.04 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  34.04 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01742  predicted aldolase  38.15 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.665846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.06 
 
 		 345 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01730  hypothetical protein  38.15 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.843477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2497  fructose-bisphosphate aldolase, class II family  38.15 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0229  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.47 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  35.82 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1974  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.47 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2058  fructose-bisphosphate aldolase, class II  37.19 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  hitchhiker  0.00173454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4316  fructose-bisphosphate aldolase, class II  35.67 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1869  ketose-bisphosphate aldolase  37.96 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00279551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1859  ketose-bisphosphate aldolase  37.96 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.175434  decreased coverage  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.33 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.15 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1997  fructose-bisphosphate aldolase, class II  37.96 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>