More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0331 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0331  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.220687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0323  hypothetical protein  98.25 
 
 
287 aa  577  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  80.07 
 
 
286 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  69.23 
 
 
287 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  53.15 
 
 
285 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.75 
 
 
283 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.79 
 
 
284 aa  222  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.37 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.4 
 
 
286 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.85 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.37 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5597  hypothetical protein  43.01 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  41.34 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  42.66 
 
 
286 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.42 
 
 
284 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  39.44 
 
 
284 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4026  hypothetical protein  41.7 
 
 
286 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0129  hypothetical protein  41.7 
 
 
286 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1033  hypothetical protein  42.46 
 
 
286 aa  201  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  38.89 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.56 
 
 
288 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  38.52 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  39.44 
 
 
284 aa  195  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  39.08 
 
 
281 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  37.85 
 
 
283 aa  194  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.75 
 
 
308 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  38.19 
 
 
287 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  38.33 
 
 
316 aa  192  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  39.86 
 
 
283 aa  191  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  36.46 
 
 
286 aa  191  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  39.24 
 
 
295 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  36.16 
 
 
309 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  35.76 
 
 
286 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  35.76 
 
 
286 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.74 
 
 
305 aa  188  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  37.72 
 
 
285 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  37.67 
 
 
307 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  38.73 
 
 
278 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  37.32 
 
 
281 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  37.8 
 
 
285 aa  185  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  37.32 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
285 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  37.8 
 
 
285 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
285 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
285 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
285 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
285 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
285 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
285 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
285 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  36.81 
 
 
283 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  34.76 
 
 
338 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  34.08 
 
 
313 aa  179  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  35.62 
 
 
308 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 
284 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.6 
 
 
323 aa  179  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 
330 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 
330 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 
330 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 
330 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
293 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  33.44 
 
 
313 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  34.25 
 
 
292 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
284 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
284 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
284 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.28 
 
 
347 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105194  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  36.36 
 
 
349 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.64 
 
 
309 aa  175  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  36.17 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  34.76 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3041  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.47 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3047  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.47 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  36.17 
 
 
285 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  36.4 
 
 
284 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  33.92 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  33.92 
 
 
286 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  33.92 
 
 
286 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  33.92 
 
 
286 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  33.92 
 
 
286 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  33.92 
 
 
286 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  33.92 
 
 
286 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  33.92 
 
 
286 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0765  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.58 
 
 
363 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.290883  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2625  ketose-bisphosphate aldolase  35.96 
 
 
281 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01742  predicted aldolase  37.78 
 
 
278 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.665846  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2058  fructose-bisphosphate aldolase, class II  36.84 
 
 
278 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  hitchhiker  0.00173454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2497  fructose-bisphosphate aldolase, class II family  37.78 
 
 
278 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01730  hypothetical protein  37.78 
 
 
278 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.843477  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  34.15 
 
 
354 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  32.65 
 
 
297 aa  169  5e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1974  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.17 
 
 
363 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0229  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  35.17 
 
 
363 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  34.6 
 
 
325 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  33.74 
 
 
354 aa  168  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  34.39 
 
 
281 aa  167  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1869  ketose-bisphosphate aldolase  37.59 
 
 
278 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00279551  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  33.74 
 
 
345 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000980725  decreased coverage  0.000076105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1859  ketose-bisphosphate aldolase  37.59 
 
 
278 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.175434  decreased coverage  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1857  fructose-bisphosphate aldolase  37.59 
 
 
278 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00760876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>