More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  52.8 
 
 
287 aa  306  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0323  hypothetical protein  53.15 
 
 
287 aa  299  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0331  hypothetical protein  53.15 
 
 
286 aa  297  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.220687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  50.7 
 
 
286 aa  292  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.79 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.29 
 
 
284 aa  228  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.46 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.4 
 
 
284 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.17 
 
 
284 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.56 
 
 
287 aa  211  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.16 
 
 
288 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  41.55 
 
 
284 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.14 
 
 
284 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.03 
 
 
308 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  38.52 
 
 
284 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  38.73 
 
 
284 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  37.68 
 
 
284 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  37.68 
 
 
284 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  37.68 
 
 
284 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  39.64 
 
 
281 aa  202  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  41.06 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  40.07 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.13 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  40.42 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  39.24 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  39.72 
 
 
287 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.13 
 
 
313 aa  196  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  40.21 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  39.74 
 
 
307 aa  195  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.05 
 
 
305 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  39.08 
 
 
283 aa  193  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.39 
 
 
307 aa  192  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 
285 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  36.62 
 
 
286 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2625  ketose-bisphosphate aldolase  40 
 
 
281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  36.75 
 
 
292 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  38.54 
 
 
286 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  38.54 
 
 
286 aa  189  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  37.58 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  36.27 
 
 
286 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  36.27 
 
 
286 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  36.27 
 
 
286 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  36.27 
 
 
286 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  36.27 
 
 
286 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  36.27 
 
 
286 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  36.27 
 
 
286 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  35.66 
 
 
295 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  36.97 
 
 
284 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  36.97 
 
 
330 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  36.97 
 
 
330 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  36.97 
 
 
330 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  36.97 
 
 
330 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  36.48 
 
 
309 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  37.86 
 
 
285 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  38.31 
 
 
307 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  36.92 
 
 
278 aa  185  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.8 
 
 
287 aa  185  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.26 
 
 
330 aa  185  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  39.13 
 
 
293 aa  185  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
285 aa  185  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.44 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  36.75 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  35.56 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  35.56 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  35.56 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  35.84 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  35.56 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3438  ketose-bisphosphate aldolase  41.01 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0588169  hitchhiker  0.000131538 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  35.56 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  35.56 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  35.56 
 
 
284 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  38.13 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  35.56 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  35.56 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.1 
 
 
311 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3218  ketose-bisphosphate aldolase  37.32 
 
 
280 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  37.59 
 
 
284 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  36.69 
 
 
283 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.39 
 
 
328 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.92 
 
 
309 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.25 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.58 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  36.82 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2337  fructose-bisphosphate aldolase  40.95 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2532  fructose-bisphosphate aldolase  40.95 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08395e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2516  fructose-bisphosphate aldolase  40.95 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2300  fructose-bisphosphate aldolase  40.95 
 
 
281 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  35.69 
 
 
281 aa  178  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  41.23 
 
 
281 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>