152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3253 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1193  ketose-bisphosphate aldolase family protein  75.41 
 
 
428 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0742776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2383  fructose-bisphosphate aldolase  77.75 
 
 
427 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563565  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3253  ketose-bisphosphate aldolase class-II  100 
 
 
427 aa  870    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3305  ketose-bisphosphate aldolase family protein  77.96 
 
 
426 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0149261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3299  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  80.33 
 
 
427 aa  725    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000284986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1007  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  99.3 
 
 
427 aa  866    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000202403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2284  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  71.56 
 
 
429 aa  626  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2461  ketose-bisphosphate aldolase family protein  71.67 
 
 
419 aa  621  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0218  ketose-bisphosphate aldolase class-II  41.53 
 
 
421 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1245  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  29.93 
 
 
364 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1611  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  36.73 
 
 
379 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.455667  normal  0.226673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1969  fructose-bisphosphate aldolase  28.19 
 
 
379 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1761  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
361 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165684  normal  0.0733362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  31.64 
 
 
287 aa  77  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  31.18 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.63 
 
 
288 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  26.62 
 
 
281 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  26.62 
 
 
281 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
286 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
286 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  31.56 
 
 
308 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0127  fructose-bisphosphate aldolase  28.08 
 
 
293 aa  63.9  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000349017  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  32.82 
 
 
286 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl644  fructose-biphosphate aldolase  31.09 
 
 
296 aa  62.4  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.73 
 
 
288 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.669513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.73 
 
 
288 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.626031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  27.84 
 
 
283 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  26.72 
 
 
285 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3990  putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.39 
 
 
286 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4006  putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.39 
 
 
286 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2168  fructose-bisphosphate aldolase  28.95 
 
 
298 aa  59.7  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00424601  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4111  putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.39 
 
 
286 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.142897  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4061  putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.01 
 
 
286 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  30.73 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.54 
 
 
297 aa  58.9  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  26.98 
 
 
325 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  32.28 
 
 
285 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  27.38 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.64 
 
 
307 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  31.5 
 
 
285 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  36.16 
 
 
281 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  27.54 
 
 
309 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  28.31 
 
 
283 aa  57.4  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2532  fructose-bisphosphate aldolase  25.88 
 
 
281 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08395e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  27.11 
 
 
287 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0305  fructose-bisphosphate aldolase  25.97 
 
 
281 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  25.78 
 
 
285 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  30.71 
 
 
287 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0649  Fructose-bisphosphate aldolase  26.89 
 
 
330 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2337  fructose-bisphosphate aldolase  25.54 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2300  fructose-bisphosphate aldolase  25.54 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  29.89 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2516  fructose-bisphosphate aldolase  25.54 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.42 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  27.41 
 
 
283 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  26.8 
 
 
324 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2358  ketose-bisphosphate aldolase  28.02 
 
 
278 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0595665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  26.59 
 
 
324 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  28.24 
 
 
283 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.83 
 
 
311 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0396  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.12 
 
 
290 aa  53.5  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.4 
 
 
287 aa  53.1  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.24 
 
 
284 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.29 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  31.82 
 
 
285 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0467  fructose/tagatose bisphosphate aldolase  29.32 
 
 
305 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0246198  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  24.83 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  28.41 
 
 
284 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1362  fructose-bisphosphate aldolase  27.17 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4828  putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.14 
 
 
286 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02960  fructose-bisphosphate aldolase  27.92 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.85 
 
 
308 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  29.92 
 
 
285 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.03 
 
 
307 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  28.41 
 
 
284 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  28.41 
 
 
284 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  31.69 
 
 
313 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  26.82 
 
 
286 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3772  putative fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.14 
 
 
286 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  27.75 
 
 
327 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  27.81 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  26.82 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  26.82 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  31.69 
 
 
313 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  26.82 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  26.82 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  28.51 
 
 
284 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  26.82 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  26.82 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.45 
 
 
284 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1045  fructose-bisphosphate aldolase  25.94 
 
 
324 aa  51.2  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468946  unclonable  0.00000168547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  26.82 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0701  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  28.75 
 
 
289 aa  50.8  0.00004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>