68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1143 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02021  putative tagatose 6-phosphate kinase 1  98.81 
 
 		 420 aa  866    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2231  putative tagatose-6-phosphate kinase  99.29 
 
 		 420 aa  870    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.26036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2383  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  99.52 
 
 		 420 aa  872    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1552  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  99.29 
 
 		 420 aa  870    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0969  putative tagatose-6-phosphate kinase  96.9 
 
 		 420 aa  828    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.566701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1143  putative tagatose-6-phosphate kinase  100 
 
 		 420 aa  875    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.291767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3515  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  73.68 
 
 		 441 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3552  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  73.68 
 
 		 423 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.263704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3446  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  73.68 
 
 		 423 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3444  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  73.44 
 
 		 441 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3612  D-tagatose-bisphosphate aldolase  73.92 
 
 		 423 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0182354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3074  putative tagatose-6-phosphate kinase  99.29 
 
 		 420 aa  870    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01987  hypothetical protein  98.81 
 
 		 420 aa  866    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1562  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  99.52 
 
 		 420 aa  872    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0080189  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1145  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  61.24 
 
 		 421 aa  553  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3572  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  54.2 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.219278 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0568  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.1 
 
 		 426 aa  441  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3612  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.1 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02948  hypothetical protein  53.1 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3322  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.1 
 
 		 426 aa  441  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02997  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaZ subunit  53.1 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0573  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.33 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2386  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.1 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4446  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  52.86 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3429  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  52.72 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3848  tagatose-6-phosphate kinase  52.4 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0942  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.08 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3106  tagatose-6-phosphate kinase  47.98 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00963647  hitchhiker  0.000335639 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0994  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  53.08 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3376  D-tagatose-bisphosphate aldolase  52.84 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.338504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3179  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  51.33 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.265096  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3817  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  50.36 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.897143  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0317  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  52.04 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0839239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0288  tagatose-6-phosphate kinase  48.67 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1008  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  48.01 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.833631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2700  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  47.98 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2601  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  48.22 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2534  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  48.22 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2145  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  48.01 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000526082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4765  tagatose-6-phosphate kinase  50.25 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.648377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0640  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  50.48 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.581785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1195  tagatose-6-phosphate kinase  50.35 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5927  tagatose-bisphosphate aldolase noncatalytic subunit  47.18 
 
 		 450 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2596  tagatose-6-phosphate kinase  47.18 
 
 		 450 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1986  tagatose-6-phosphate kinase  47.18 
 
 		 450 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2620  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  46.95 
 
 		 450 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4762  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  46.31 
 
 		 433 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.715507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0694  hypothetical protein  45.25 
 
 		 477 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2644  tagatose-6-phosphate kinase  46.5 
 
 		 452 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2512  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  46.5 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0701  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  47.63 
 
 		 443 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344652  normal  0.544688 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5361  D-tagatose-bisphosphate aldolase, class II, non-catalytic subunit  46.31 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583103  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4847  tagatose-6-phosphate kinase  45.68 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0874  tagatose 6-phosphate kinase  42.32 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1033  putative tagatose 6-phosphate kinase protein  42.32 
 
 		 498 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0870  tagatose 6-phosphate kinase  42.32 
 
 		 498 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14550  predicted tagatose 6-phosphate kinase  43.16 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.107814 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2464  putative tagatose 6-phosphate kinase gatZ  44.24 
 
 		 481 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0630  tagatose 6 phosphate kinase  44.24 
 
 		 481 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0262  Tagatose-6-phosphate kinase  44.04 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0291  D-tagatose-bisphosphate aldolase class II accessory protein AgaZ  44.28 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.849518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0385  Tagatose-6-phosphate kinase  40 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3587  hypothetical protein  43.68 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00157379  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1192  tagatose-6-phosphate kinase  40.89 
 
 		 427 aa  262  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2483  tagatose-6-phosphate kinase  42.6 
 
 		 290 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2543  hypothetical protein  30.94 
 
 		 420 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1245  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  33.04 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1761  fructose-bisphosphate aldolase  28.8 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165684  normal  0.0733362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>