40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0524 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0524  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.418393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3009  hypothetical protein  82.33 
 
 		 285 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17787  normal  0.91489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0608  hypothetical protein  74.03 
 
 		 285 aa  363  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0352  hypothetical protein  67.39 
 
 		 289 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.819934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0333  hypothetical protein  66.96 
 
 		 289 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3662299999999996e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0025  hypothetical protein  65.28 
 
 		 296 aa  298  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0410  hypothetical protein  56.52 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0347  hypothetical protein  41.15 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2841  hypothetical protein  39.62 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1392  hypothetical protein  42.29 
 
 		 326 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2557  hypothetical protein  42.08 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1291  hypothetical protein  41.63 
 
 		 329 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1306  hypothetical protein  61.39 
 
 		 336 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3045  hypothetical protein  37.32 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2123  hypothetical protein  38.42 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1510  hypothetical protein  40.11 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000524399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2907  hypothetical protein  35.32 
 
 		 289 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0660  hypothetical protein  34.62 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1579  hypothetical protein  38.46 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000340364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5052  hypothetical protein  37.8 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.610443  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0495  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2453  hypothetical protein  33.49 
 
 		 254 aa  121  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.683144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08066  hypothetical protein  32.7 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0537  hypothetical protein  29.81 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00291593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1641  hypothetical protein  33.52 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1815  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1147  hypothetical protein  33.73 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0604  hypothetical protein  33.17 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1578  hypothetical protein  33.49 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0395  hypothetical protein  34.68 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1137  hypothetical protein  32.4 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0709  hypothetical protein  31.22 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000170117  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0101  hypothetical protein  42.98 
 
 		 258 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0787  hypothetical protein  31.16 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.914864  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0721  hypothetical protein  33.15 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.660165  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1461  hypothetical protein  47.14 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  26.14 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  37.84 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  35.44 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1460  hypothetical protein  25.47 
 
 		 177 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>