37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0352 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0352  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.819934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0333  hypothetical protein  94.81 
 
 		 289 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3662299999999996e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3009  hypothetical protein  70.18 
 
 		 285 aa  421  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17787  normal  0.91489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0608  hypothetical protein  69.37 
 
 		 285 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0025  hypothetical protein  62.63 
 
 		 296 aa  354  7.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0410  hypothetical protein  58.45 
 
 		 287 aa  344  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0524  hypothetical protein  67.39 
 
 		 235 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.418393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0347  hypothetical protein  42.41 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1510  hypothetical protein  38.17 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000524399 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1392  hypothetical protein  37.1 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2841  hypothetical protein  37.26 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2557  hypothetical protein  37.23 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1291  hypothetical protein  36.86 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2123  hypothetical protein  35.32 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3045  hypothetical protein  36.29 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1306  hypothetical protein  38.55 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0495  hypothetical protein  35.36 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5052  hypothetical protein  36.33 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.610443  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2907  hypothetical protein  36.01 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0537  hypothetical protein  29.48 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00291593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2453  hypothetical protein  34.6 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.683144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08066  hypothetical protein  32.08 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1579  hypothetical protein  35.27 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000340364  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0604  hypothetical protein  33.58 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0660  hypothetical protein  32.37 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1578  hypothetical protein  33.08 
 
 		 249 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1815  hypothetical protein  31.02 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0709  hypothetical protein  32.22 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000170117  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1147  hypothetical protein  31.93 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1641  hypothetical protein  30.66 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0721  hypothetical protein  32.71 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.660165  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1137  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0787  hypothetical protein  30.34 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.914864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0395  hypothetical protein  30.42 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0101  hypothetical protein  29.03 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1461  hypothetical protein  41.43 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1460  hypothetical protein  26.9 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>