37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1579 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1579  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000340364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0347  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222932  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1510  hypothetical protein  50.4 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524399 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0537  hypothetical protein  35.29 
 
 
269 aa  175  7e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00291593  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2841  hypothetical protein  35.6 
 
 
260 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1578  hypothetical protein  38.21 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3009  hypothetical protein  36.98 
 
 
285 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17787  normal  0.91489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0352  hypothetical protein  35.27 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.819934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0025  hypothetical protein  35.36 
 
 
296 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0410  hypothetical protein  36.68 
 
 
287 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0333  hypothetical protein  34.78 
 
 
289 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3662299999999996e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0608  hypothetical protein  36 
 
 
285 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3045  hypothetical protein  35.48 
 
 
273 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184517 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0604  hypothetical protein  35.12 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5052  hypothetical protein  34.94 
 
 
266 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.610443  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2453  hypothetical protein  30.68 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.683144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08066  hypothetical protein  29.6 
 
 
262 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0660  hypothetical protein  32.26 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0495  hypothetical protein  33.61 
 
 
257 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0524  hypothetical protein  38.46 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.418393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2123  hypothetical protein  34.02 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1392  hypothetical protein  38.76 
 
 
326 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2557  hypothetical protein  37.83 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1306  hypothetical protein  41.87 
 
 
336 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668122  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1291  hypothetical protein  36.43 
 
 
329 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191656  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1815  hypothetical protein  30.74 
 
 
254 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1641  hypothetical protein  29.92 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2907  hypothetical protein  31.6 
 
 
289 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0709  hypothetical protein  29.72 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000170117  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0721  hypothetical protein  29.17 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.660165  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0101  hypothetical protein  28.96 
 
 
258 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1147  hypothetical protein  31.78 
 
 
256 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0395  hypothetical protein  30.12 
 
 
249 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0787  hypothetical protein  29.88 
 
 
254 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.914864  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1137  hypothetical protein  30.17 
 
 
251 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1461  hypothetical protein  41.89 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1460  hypothetical protein  25 
 
 
177 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>