37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0333 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0333  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3662299999999996e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0352  hypothetical protein  94.81 
 
 
289 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.819934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3009  hypothetical protein  70.18 
 
 
285 aa  417  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17787  normal  0.91489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0608  hypothetical protein  70.07 
 
 
285 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0025  hypothetical protein  62.63 
 
 
296 aa  352  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0410  hypothetical protein  58.45 
 
 
287 aa  343  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0524  hypothetical protein  66.96 
 
 
235 aa  317  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.418393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0347  hypothetical protein  43.03 
 
 
270 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222932  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1510  hypothetical protein  38.22 
 
 
256 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524399 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2841  hypothetical protein  38.08 
 
 
260 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1392  hypothetical protein  37.81 
 
 
326 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2557  hypothetical protein  38.18 
 
 
329 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1291  hypothetical protein  38.41 
 
 
329 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3045  hypothetical protein  36.95 
 
 
273 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1306  hypothetical protein  38.96 
 
 
336 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668122  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2123  hypothetical protein  34.13 
 
 
264 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0537  hypothetical protein  30.97 
 
 
269 aa  149  6e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00291593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5052  hypothetical protein  36.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.610443  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2907  hypothetical protein  34.97 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0495  hypothetical protein  35.54 
 
 
257 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1579  hypothetical protein  34.78 
 
 
267 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000340364  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2453  hypothetical protein  32.03 
 
 
254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.683144  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0604  hypothetical protein  33.21 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08066  hypothetical protein  30.57 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0660  hypothetical protein  32.37 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1578  hypothetical protein  33.85 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1815  hypothetical protein  30.43 
 
 
254 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1147  hypothetical protein  31.93 
 
 
256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0709  hypothetical protein  32.79 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000170117  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1641  hypothetical protein  28.83 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0721  hypothetical protein  33.2 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.660165  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1137  hypothetical protein  31.15 
 
 
251 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0787  hypothetical protein  29.96 
 
 
254 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.914864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0395  hypothetical protein  30.13 
 
 
249 aa  105  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0101  hypothetical protein  30.66 
 
 
258 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1461  hypothetical protein  41.43 
 
 
77 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1460  hypothetical protein  24.37 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>