38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4113 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4113  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  554  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4022  hypothetical protein  90.88 
 
 		 274 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0460  hypothetical protein  59.57 
 
 		 260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1194  hypothetical protein  45.42 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2930  cytochrome c family protein  49.47 
 
 		 205 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0541  hypothetical protein  48.65 
 
 		 187 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  29.52 
 
 		 199 aa  53.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  34.83 
 
 		 354 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  37.63 
 
 		 112 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 132 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0250  cytochrome c class I  33.85 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.312298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  34.44 
 
 		 104 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  33.01 
 
 		 132 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  28.4 
 
 		 123 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  33.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  34.44 
 
 		 111 aa  46.2  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3205  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 474 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  27.06 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  28.83 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  36.56 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 118 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0468  cytochrome c, class I  35.56 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  34.83 
 
 		 118 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  34.21 
 
 		 188 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0488  cytochrome c, class I  27.73 
 
 		 169 aa  42.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 143 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  32.22 
 
 		 212 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2070  cytochrome c2  33 
 
 		 122 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  31.82 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 131 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  34.12 
 
 		 371 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 166 aa  42.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  29.35 
 
 		 175 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>