12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0460 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0460  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  541  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4022  hypothetical protein  59.57 
 
 		 274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4113  hypothetical protein  59.46 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1194  hypothetical protein  45.28 
 
 		 264 aa  224  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2930  cytochrome c family protein  45.15 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0541  hypothetical protein  48.13 
 
 		 187 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 118 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  27.37 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  31.51 
 
 		 308 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  32.63 
 
 		 104 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 118 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 127 aa  42  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>