19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0541 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0541  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2930  cytochrome c family protein  68.45 
 
 		 205 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0460  hypothetical protein  48.13 
 
 		 260 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1194  hypothetical protein  45.41 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4022  hypothetical protein  47.57 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4113  hypothetical protein  49.71 
 
 		 274 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3893  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.894591  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  28.89 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  29.91 
 
 		 130 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  27.55 
 
 		 123 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  35.16 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  36.56 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1416  hypothetical protein  31.08 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3383  cytochrome c class I  29.35 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  28.74 
 
 		 372 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  28.74 
 
 		 372 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  22.34 
 
 		 743 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  28.74 
 
 		 381 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  26.44 
 
 		 355 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>