13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0860 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0860    100 
 
 		 762 bp  1511    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  87.3 
 
 		 1221 bp  246  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  87.3 
 
 		 1200 bp  246  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  85.71 
 
 		 1200 bp  214  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  85.77 
 
 		 1200 bp  210  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  84.92 
 
 		 1200 bp  198  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1107    84.98 
 
 		 958 bp  192  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  84.54 
 
 		 1200 bp  73.8  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  84.54 
 
 		 1200 bp  73.8  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2965    84.93 
 
 		 228 bp  58  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.522525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7077    87.72 
 
 		 348 bp  58  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2680  transposase  86.79 
 
 		 690 bp  50.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  96.43 
 
 		 1122 bp  48.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>