12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1107 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1107    100 
 
 		 958 bp  1899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  91.9 
 
 		 1200 bp  1285    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  92 
 
 		 1221 bp  1292    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  94.08 
 
 		 1200 bp  1451    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  83.39 
 
 		 1200 bp  634  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  83.28 
 
 		 1200 bp  626  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0860    84.98 
 
 		 762 bp  192  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  86.47 
 
 		 1200 bp  147  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  86.47 
 
 		 1200 bp  147  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2680  transposase  95.65 
 
 		 690 bp  75.8  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7077    94.29 
 
 		 348 bp  54  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2965    96.55 
 
 		 228 bp  50.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.522525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>