13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2965 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2965    100 
 
 		 228 bp  452  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.522525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  83.25 
 
 		 1200 bp  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  83.25 
 
 		 1200 bp  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2680  transposase  95.31 
 
 		 690 bp  103  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7077    94.55 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  91.67 
 
 		 1200 bp  63.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0860    84.93 
 
 		 762 bp  58  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  88.24 
 
 		 1200 bp  56  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  94.29 
 
 		 1200 bp  54  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1107    96.55 
 
 		 958 bp  50.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  88.89 
 
 		 1221 bp  50.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  93.75 
 
 		 1200 bp  48.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0138  hypothetical protein  100 
 
 		 366 bp  46.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>