12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7077 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7077    100 
 
 		 348 bp  690    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1768    84.31 
 
 		 319 bp  113  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2965    94.55 
 
 		 228 bp  85.7  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.522525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  83.7 
 
 		 1200 bp  77.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  90.16 
 
 		 1200 bp  73.8  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  90.16 
 
 		 1200 bp  73.8  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 1200 bp  69.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  97.22 
 
 		 1221 bp  63.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  97.22 
 
 		 1200 bp  63.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  97.22 
 
 		 1200 bp  63.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0860    87.72 
 
 		 762 bp  58  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1107    94.29 
 
 		 958 bp  54  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>