More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3822 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3822  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  688    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0763012  normal  0.0331806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0894  diacylglycerol kinase catalytic region  68.79 
 
 		 316 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495381  normal  0.488234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3269  diacylglycerol kinase catalytic region  51.35 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0313092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  33.22 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1799  diacylglycerol kinase catalytic region  46.74 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0029568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2775  diacylglycerol kinase catalytic region  41.85 
 
 		 289 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4589  diacylglycerol kinase, catalytic region  39.07 
 
 		 307 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  37.06 
 
 		 291 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1959  diacylglycerol kinase catalytic region  38.81 
 
 		 294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.743891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3762  diacylglycerol kinase  35.14 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4839  diacylglycerol kinase catalytic region  36.96 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0439501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1821  diacylglycerol kinase catalytic region  37.63 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  35.07 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2062  diacylglycerol kinase catalytic region  39.23 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  0.170791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1884  diacylglycerol kinase catalytic region  40.14 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2655  diacylglycerol kinase, catalytic region  35.27 
 
 		 291 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1639  diacylglycerol kinase catalytic region  41.81 
 
 		 298 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16442  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2771  diacylglycerol kinase  34.67 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148668  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12281  diacylglycerol kinase  35.02 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.538329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2372  diacylglycerol kinase catalytic region  36.95 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5857  hypothetical protein  37.11 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.924952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3375  diacylglycerol kinase  36.24 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3437  diacylglycerol kinase  36.24 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00697361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3386  diacylglycerol kinase  36.24 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2254  diacylglycerol kinase, catalytic region  38.64 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.278612  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  26.42 
 
 		 318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2734  hypothetical protein  35.28 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0813  diacylglycerol kinase catalytic region  26.69 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2148  diacylglycerol kinase catalytic region  33.99 
 
 		 314 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21940  conserved protein of unknown function BmrU  35.95 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  0.451971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18510  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  33.24 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0650618  normal  0.0224505 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  29.2 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2441  diacylglycerol kinase catalytic region  33.33 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11690  conserved protein of unknown function BmrU  33.78 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3028  diacylglycerol kinase catalytic region  34.58 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1711  diacylglycerol kinase catalytic region  29.41 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1757  diacylglycerol kinase catalytic region  29.45 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3084  sphingosine kinase related enzyme  37.69 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.407765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2567  diacylglycerol kinase catalytic region  31.4 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.979042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  24.41 
 
 		 296 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1516  diacylglycerol kinase catalytic region  34.35 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.251162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2253  diacylglycerol kinase catalytic region  37.08 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  28.76 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16010  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  33.12 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0393  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.03 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0393706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  31.49 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  33.2 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_002936  DET0414  hypothetical protein  29.19 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0557912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_357  hypothetical protein  29.57 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000445799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1424  diacylglycerol kinase catalytic region  32.67 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  28.52 
 
 		 291 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2397  diacylglycerol kinase catalytic region  26.3 
 
 		 310 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1322  diacylglycerol kinase catalytic region  32.67 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2295  hypothetical protein  27.36 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  35.22 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1852  diacylglycerol kinase catalytic region  31.76 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2268  hypothetical protein  26.62 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  29.63 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  29.79 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  32.99 
 
 		 287 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  29.63 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  28.52 
 
 		 291 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  25.6 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1871  diacylglycerol kinase catalytic region  36.42 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.162072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3700  diacylglycerol kinase catalytic region  31.13 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  33.33 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  30.37 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0561  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.81 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.323865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  32.05 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0225  diacylglycerol kinase catalytic region  27.62 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000001746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2527  hypothetical protein  31.7 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  28.87 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  30.74 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  26.96 
 
 		 294 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3942  diacylglycerol kinase catalytic region  26.77 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  29.63 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  33.9 
 
 		 297 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2039  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.68 
 
 		 309 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000368656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0354  hypothetical protein  29.17 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00832557  normal  0.551601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3057  hypothetical protein  33.56 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  29.01 
 
 		 297 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  30.39 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0576  diacylglycerol kinase catalytic region  27.48 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  25.91 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01350  conserved protein of unknown function BmrU  29.52 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  31.74 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  36.09 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  28.32 
 
 		 287 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  25.43 
 
 		 300 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  28.03 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0967  hypothetical protein  33.78 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273578  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  32.31 
 
 		 313 aa  95.9  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1778  diacylglycerol kinase catalytic region  33.8 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.43 
 
 		 300 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2187  diacylglycerol kinase catalytic region  32.16 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.670383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  31.96 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0403  diacylglycerol kinase catalytic region  30.24 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.749946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  24.83 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  25.09 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  25.09 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>