20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0132 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 392 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  42.51 
 
 		 256 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 282 aa  158  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4856  transcriptional regulator, XRE family  46.47 
 
 		 247 aa  154  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1522  hypothetical protein  46.34 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4862  hypothetical protein  44.05 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8671  hypothetical protein  43.27 
 
 		 246 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8697  hypothetical protein  43.27 
 
 		 246 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  40.24 
 
 		 249 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8677  hypothetical protein  42.86 
 
 		 244 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5995  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113764 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5594  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  32.16 
 
 		 266 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  32.16 
 
 		 266 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  32.16 
 
 		 266 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3032  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 272 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7030  hypothetical protein  30.54 
 
 		 260 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.292023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7026  hypothetical protein  30.54 
 
 		 201 aa  97.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30300  hypothetical protein  26.23 
 
 		 296 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.92988  normal  0.817284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>