20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3169 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3032  helix-turn-helix domain-containing protein  84.27 
 
 		 272 aa  455  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5594  XRE family transcriptional regulator  95.6 
 
 		 182 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5995  XRE family transcriptional regulator  95.6 
 
 		 182 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  35.48 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4856  transcriptional regulator, XRE family  36.22 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  34 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8697  hypothetical protein  34.4 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8671  hypothetical protein  34.4 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4862  hypothetical protein  35.71 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8677  hypothetical protein  34.94 
 
 		 244 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 392 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1522  hypothetical protein  38.1 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  32.16 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7030  hypothetical protein  27.94 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.292023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7026  hypothetical protein  26.18 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30300  hypothetical protein  24.74 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.92988  normal  0.817284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>