11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30300  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.92988  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0893  hypothetical protein  49.66 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  23.5 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2351  hypothetical protein  26.63 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  24.18 
 
 		 256 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  24.74 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  24.74 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  24.74 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0793  hypothetical protein  26.55 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.025957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  26.23 
 
 		 180 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>