27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3120 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3120  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4856  transcriptional regulator, XRE family  48.99 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8697  hypothetical protein  45.15 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8671  hypothetical protein  45.15 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4862  hypothetical protein  43.39 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8966  hypothetical protein  41.53 
 
 		 256 aa  184  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0337189  normal  0.659261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8677  hypothetical protein  43.98 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5332  XRE family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 392 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1136  XRE family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7030  hypothetical protein  33.61 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.292023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1522  hypothetical protein  44.72 
 
 		 193 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3181  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3169  hypothetical protein  34 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346295  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0132  hypothetical protein  40.24 
 
 		 180 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3032  helix-turn-helix domain-containing protein  35.22 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5995  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 182 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113764 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5594  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 182 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7026  hypothetical protein  31.15 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3010  hypothetical protein  40.98 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  41.67 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  41.67 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  46.48 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  46.48 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30300  hypothetical protein  23.5 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.92988  normal  0.817284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  41.43 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>